RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568043.5

INO80E-212, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-212ENST00000568043 LCORLQ8N3X6 602 aa22.06■■□□□ 1.12
INO80E-212ENST00000568043 USP38Q8NB14 1042 aa22.06■■□□□ 1.12
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INO80E-212ENST00000568043 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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INO80E-212ENST00000568043 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.06■■□□□ 1.12
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INO80E-212ENST00000568043 A0A1W2PQY0 241 aa22.03■■□□□ 1.12
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INO80E-212ENST00000568043 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.111e-10■□□□□ 11
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INO80E-212ENST00000568043 KCTD2Q14681 263 aa21.96■■□□□ 1.11
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INO80E-212ENST00000568043 SH2D4AQ9H788 454 aa21.96■■□□□ 1.11
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INO80E-212ENST00000568043 NCOR1O75376 2440 aa21.95■■□□□ 1.1
INO80E-212ENST00000568043 USP17L12C9JPN9 530 aa21.95■■□□□ 1.1
INO80E-212ENST00000568043 USP17L21D6R901 530 aa21.95■■□□□ 1.1
INO80E-212ENST00000568043 ADCY6O43306 1168 aa21.95■■□□□ 1.1
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INO80E-212ENST00000568043 ADD2P35612 726 aa21.95■■□□□ 1.1
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