RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 SPC24Q8NBT2 197 aa9.35□□□□□ -0.91
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PTPRD-211ENST00000486161 ZHX2Q9Y6X8 837 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1B0GVL5 298 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-211ENST00000486161 USP17L10C9JJH3 530 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-211ENST00000486161 TRAPPC10P48553 1259 aa9.35□□□□□ -0.91
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PTPRD-211ENST00000486161 PPP1R2P41236 205 aa9.33□□□□□ -0.92
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PTPRD-211ENST00000486161 STK36Q9NRP7 1315 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 OR52Z1P0C646 297 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 FDX1P10109 184 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 PRR16Q569H4 304 aa9.32□□□□□ -0.92
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