RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTN-222ENST00000612341 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.67□□□□□ -0.06
SMTN-222ENST00000612341 NID2Q14112 1375 aa14.66□□□□□ -0.06
SMTN-222ENST00000612341 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SMTN-222ENST00000612341 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa14.66□□□□□ -0.06
SMTN-222ENST00000612341 PLIN2Q99541 437 aa14.66□□□□□ -0.06
SMTN-222ENST00000612341 MTA3Q9BTC8 594 aa14.66□□□□□ -0.06
SMTN-222ENST00000612341 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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SMTN-222ENST00000612341 USP17L4A6NCW7 530 aa14.66□□□□□ -0.06
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SMTN-222ENST00000612341 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.66□□□□□ -0.06
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SMTN-222ENST00000612341 NT5DC1Q5TFE4 455 aa14.64□□□□□ -0.07
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SMTN-222ENST00000612341 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.63□□□□□ -0.07
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SMTN-222ENST00000612341 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
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SMTN-222ENST00000612341 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.63□□□□□ -0.07
SMTN-222ENST00000612341 TRIML1Q8N9V2 468 aa14.63□□□□□ -0.07
SMTN-222ENST00000612341 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMTN-222ENST00000612341 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.63□□□□□ -0.07
SMTN-222ENST00000612341 WDR24Q96S15 920 aa14.63□□□□□ -0.07
SMTN-222ENST00000612341 CARD6Q9BX69 1037 aa14.63□□□□□ -0.07
SMTN-222ENST00000612341 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.63□□□□□ -0.07
SMTN-222ENST00000612341 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMTN-222ENST00000612341 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.62□□□□□ -0.07
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