RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 HPSEQ9Y251 543 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 CUTAO60888 179 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF202O95125 648 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 CDK8P49336 464 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF165P49910 485 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 STX1AQ16623 288 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 LUZP1Q86V48 1076 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 SLC44A5Q8NCS7 719 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 TIGD1Q96MW7 591 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 DNAJC25Q9H1X3 360 aa9.43□□□□□ -0.9
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PDE4D-208ENST00000502484 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 PSME4Q14997 1843 aa9.43□□□□□ -0.9
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PDE4D-208ENST00000502484 USP17L4A6NCW7 530 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 AP5Z1O43299 807 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 KRT2P35908 639 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 GRM4Q14833 912 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 RESP18Q5W5W9 173 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 SHC4Q6S5L8 630 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 SDF4Q9BRK5 362 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 SCG2P13521 617 aa9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 NPY5RQ15761 445 aa9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 DOK7Q18PE1 504 aa9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 PODNQ7Z5L7 613 aa9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 NEDD1Q8NHV4 660 aa9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 CEP131Q9UPN4 1083 aa9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 SBF1O95248 1867 aa9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 MYH4Q9Y623 1939 aa9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 SYKP43405 635 aa9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 GNAQP50148 359 aa9.42□□□□□ -0.9
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PDE4D-208ENST00000502484 FBXW7Q969H0 707 aa9.42□□□□□ -0.9
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PDE4D-208ENST00000502484 CABP5Q9NP86 173 aa9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 ANO10Q9NW15 660 aa9.42□□□□□ -0.9
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PDE4D-208ENST00000502484 NFKBIEO00221 500 aa9.41□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 PTPREP23469 700 aa9.41□□□□□ -0.9
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PDE4D-208ENST00000502484 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 CLIC6Q96NY7 704 aa9.41□□□□□ -0.9
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PDE4D-208ENST00000502484 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
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PDE4D-208ENST00000502484 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
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PDE4D-208ENST00000502484 PICALMQ13492 652 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 STRIP1Q5VSL9 837 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
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