RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 CREG2Q8IUH2 290 aa6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 RNF141Q8WVD5 230 aa6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 GMIPQ9P107 970 aa6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 UBOX5O94941 541 aa6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 ATE1O95260 518 aa6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF165P49910 485 aa6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 BIN1O00499 593 aa6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 RGS13O14921 159 aa6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 ATG4CQ96DT6 458 aa6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 ASIC4Q96FT7 647 aa6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 SHISA3A0PJX4 238 aa6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 ESR1P03372 595 aa6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 FYB2Q5VWT5 728 aa6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 OGFOD2Q6N063 350 aa6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM168AQ92567 244 aa6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 DUSP13Q9UII6 198 aa6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.49□□□□□ -1.37
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TIMMDC1-209ENST00000498399 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.48□□□□□ -1.37
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TIMMDC1-209ENST00000498399 ASPNQ9BXN1 380 aa6.48□□□□□ -1.37
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TIMMDC1-209ENST00000498399 PPT2Q9UMR5 302 aa6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 SRFP11831 508 aa6.47□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 LTKP29376 864 aa6.47□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 HK2P52789 917 aa6.47□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 EGR3Q06889 387 aa6.47□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.47□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 GAB4Q2WGN9 574 aa6.47□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.47□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 FLAD1Q8NFF5 587 aa6.47□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.47□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.47□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.47□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.47□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.47□□□□□ -1.37
TIMMDC1-209ENST00000498399 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
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TIMMDC1-209ENST00000498399 PAK2Q13177 524 aa6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 TTC6Q86TZ1 520 aa6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 VWCEQ96DN2 955 aa6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 CLEC3AO75596 197 aa6.45□□□□□ -1.38
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TIMMDC1-209ENST00000498399 RNF4P78317 190 aa6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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TIMMDC1-209ENST00000498399 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM192Q8IY95 271 aa6.45□□□□□ -1.38
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TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC9A7Q96T83 725 aa6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 GDNFP39905 211 aa6.44□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 AFMP43652 599 aa6.44□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.44□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.44□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 KIRREL1Q96J84 757 aa6.44□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 GINM1Q9NU53 330 aa6.44□□□□□ -1.38
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.44□□□□□ -1.38
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