RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430287.1

USP9YP16-201, Transcript of USP9Y pseudogene 16, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP16, Length 407 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP16-201ENST00000430287 ELMO3Q96BJ8 720 aa4.84□□□□□ -1.63
USP9YP16-201ENST00000430287 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP9YP16-201ENST00000430287 PCED1AQ9H1Q7 454 aa4.84□□□□□ -1.63
USP9YP16-201ENST00000430287 ARID3CA6NKF2 412 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 CST3P01034 146 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 LTKP29376 864 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 GALK1P51570 392 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 GRM2Q14416 872 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 NKG7Q16617 165 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 LDHDQ86WU2 507 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 LINC01599Q8WXQ3 324 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 Q96M66 194 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 CITED4Q96RK1 184 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 FAM129BQ96TA1 746 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 PPP4R2Q9NY27 417 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 PCDHA4Q9UN74 947 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 NOTOA8MTQ0 251 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 ETV3P41162 512 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 NT5DC1Q5TFE4 455 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 C14orf37Q86TY3 774 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 CDH24Q86UP0 819 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 HID1Q8IV36 788 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 SIRT2Q8IXJ6 389 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 CCDC74AQ96AQ1 378 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 WNT10AQ9GZT5 417 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 C1orf115Q9H7X2 142 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 EBF1Q9UH73 591 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 SAMM50Q9Y512 469 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 ICMTO60725 284 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 FCGRTP55899 365 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 PDE3BQ13370 1112 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 CCDC82Q8N4S0 544 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 NRDCO43847 1150 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 BMP6P22004 513 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 TMEM62Q0P6H9 643 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 C8orf49Q96NF6 230 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 BRPF3Q9ULD4 1205 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 ZNF281Q9Y2X9 895 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 PCSK5Q92824 1860 aa4.79□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa4.79□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 PNLIPP16233 465 aa4.79□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 ERVFRD-1P60508 538 aa4.79□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 ARHGAP4P98171 946 aa4.79□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 ORC1Q13415 861 aa4.79□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 LRRC14Q15048 493 aa4.79□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 ZNF575Q86XF7 245 aa4.79□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa4.79□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 ABL1P00519 1130 aa4.78□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 CNR2P34972 360 aa4.78□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 PURAQ00577 322 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 TEKQ02763 1124 aa4.78□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 LIPIQ6XZB0 460 aa4.78□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 HDXQ7Z353 690 aa4.78□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 G6PC3Q9BUM1 346 aa4.78□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 KCNH3Q9ULD8 1083 aa4.78□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 DUSP10Q9Y6W6 482 aa4.78□□□□□ -1.64
USP9YP16-201ENST00000430287 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 EFEMP2O95967 443 aa4.77□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 MPOP05164 745 aa4.77□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 ETF1P62495 437 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 LLGL2Q6P1M3 1020 aa4.77□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 ERICH6Q7L0X2 663 aa4.77□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 XAGE3Q8WTP9 111 aa4.77□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 LOXL4Q96JB6 756 aa4.77□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 ANO2Q9NQ90 1003 aa4.77□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 NDUFB5O43674 189 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 INPP5AQ14642 412 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 VWA3BQ502W6 1294 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 LRFN4Q6PJG9 635 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 SPRED1Q7Z699 444 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 SPATA25Q9BR10 227 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 LNPKQ9C0E8 428 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 KLHL14Q9P2G3 628 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 IRS2Q9Y4H2 1338 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 SLC14A2Q15849 920 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 TMC6Q7Z403 805 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 DTWD2Q8NBA8 298 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 CHST13Q8NET6 341 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 SH3D21A4FU49 640 aa4.74□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa4.74□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 GPR182O15218 404 aa4.74□□□□□ -1.65
USP9YP16-201ENST00000430287 NOBOXO60393 691 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms