RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 ITPK1Q13572 414 aa4.14□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa4.14□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 TXLNAP40222 546 aa4.14□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 TXNRD3Q86VQ6 643 aa4.14□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 PLAGL2Q9UPG8 496 aa4.14□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 IQCKQ8N0W5 287 aa4.14□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 CASZ1Q86V15 1759 aa4.14□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 MYO1CO00159 1063 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 BRD3Q15059 726 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 C14orf37Q86TY3 774 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 ABHD10Q9NUJ1 306 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 SIK3Q9Y2K2 1263 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 NRAPQ86VF7 1730 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PQC6 194 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK17Q00537 523 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC39AQ5SRH9 613 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 CNNM4Q6P4Q7 775 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 VIPAS39Q9H9C1 493 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 GDAQ9Y2T3 454 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 C10orf71Q711Q0 1435 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 RGL2O15211 777 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 DEXIO95424 95 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO33Q7Z6M2 555 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 SRLQ86TD4 932 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 BAP1Q92560 729 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 KAT2BQ92831 832 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM60Q9H2L4 133 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCB6Q9NP58 842 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 MYBP10242 640 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 CRYGNQ8WXF5 182 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM10Q9UDY6 481 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 TFR2Q9UP52 801 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 CPP00450 1065 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 BCAMP50895 628 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP2R5BQ15173 497 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 ECM1Q16610 540 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC10A5Q5PT55 438 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 UBXN4Q92575 508 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 MYO1AQ9UBC5 1043 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 MROH5Q6ZUA9 1318 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 RHOBTB3O94955 611 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 OAS2P29728 719 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 GNG11P61952 73 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 CFAP100Q494V2 611 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 CENPPQ6IPU0 288 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXR2Q6PJQ5 311 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 ARMT1Q9H993 441 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 CTR9Q6PD62 1173 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 HDAC7Q8WUI4 952 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 USP14P54578 494 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 STK4Q13043 487 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 JMYQ8N9B5 988 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 CHMP4CQ96CF2 233 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC51Q96ER9 411 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 ERGIC2Q96RQ1 377 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 TLR10Q9BXR5 811 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 CCSER1Q9C0I3 900 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM59LQ9UK28 342 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 DUSP10Q9Y6W6 482 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 DOT1LQ8TEK3 1739 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 LGALS16A8MUM7 142 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 SMC2O95347 1197 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP2R3AQ06190 1150 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNB1Q14721 858 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 PDILTQ8N807 584 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 DAGLBQ8NCG7 672 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 PDE8AO60658 829 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 TOP1P11387 765 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAPPC10P48553 1259 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 PPARAQ07869 468 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC57Q2TAC2 916 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
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