RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322054.9

EHD3-201, Transcript of EH domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EHD3, Length 4,636 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3-201ENST00000322054 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa18.07■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 TRIM37O94972 964 aa18.07■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 FAM107BQ9H098 131 aa18.07■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 PPP2R3AQ06190 1150 aa18.07■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP18.07■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 TECP42680 631 aa18.07■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 ADKP55263 362 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 LONRF3Q496Y0 759 aa18.07■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 C2CD5Q86YS7 1000 aa18.07■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 FLAD1Q8NFF5 587 aa18.07■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 ATP10DQ9P241 1426 aa18.06■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 A0A087WWV3 80 aa18.06■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 CCDC169A6NNP5 214 aa18.06■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 NBPF26B4DH59 902 aa18.06■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 IFNAR1P17181 557 aa18.06■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 GJC1P36383 396 aa18.06■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 NIM1KQ8IY84 436 aa18.06■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 NBPF15Q8N660 670 aa18.06■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 HOMER2Q9NSB8 354 aa18.06■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 POLR3EQ9NVU0 708 aa18.06■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 TUBB4BP68371 445 aa18.06■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 NEK8Q86SG6 692 aa18.06■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 ACTN2P35609 894 aa18.06■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 NR5A1Q13285 461 aa18.06■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 SLF1Q9BQI6 1058 aa18.06■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 PSTPIP2Q9H939 334 aa18.06■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 EZRP15311 586 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 LINC00301Q8NCQ3 95 aa18.05■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 NUP58Q9BVL2 599 aa18.05■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 OR52Z1P0C646 297 aa18.05■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 DIXDC1Q155Q3 683 aa18.05■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 KIFC2Q96AC6 838 aa18.05■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa18.05■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 PCDHA12Q9UN75 941 aa18.05■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 HARSP12081 509 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa18.05■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 MAGEA1P43355 309 aa18.04■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 CRB1P82279 1406 aa18.04■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 PRKG1Q13976 671 aa18.04■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 RASGRP4Q8TDF6 673 aa18.04■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa18.04■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 BBOX1O75936 387 aa18.04■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 EEF2P13639 858 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 RESTQ13127 1097 aa18.04■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 LIFRP42702 1097 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 VAV2P52735 878 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 BIRC3Q13489 604 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 CLEC4GQ6UXB4 293 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 TRIML1Q8N9V2 468 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 MYRIPQ8NFW9 859 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 TUBBP07437 444 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 ICA1Q05084 483 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 CHURC1Q8WUH1 139 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 EEF2KMTQ96G04 330 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 NT5C3AQ9H0P0 336 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 MYCT1Q8N699 235 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 IFT81Q8WYA0 676 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 JAKMIP2Q96AA8 810 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 CSRNP2Q9H175 543 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 SMTNP53814 917 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 DPCR1Q3MIW9 517 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 VWA3BQ502W6 1294 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 ISCA1Q9BUE6 129 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 NLRC4Q9NPP4 1024 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 LAMC1P11047 1609 aa18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa18.02■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 USP17L8P0C7I0 530 aa18.02■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa18.02■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 CNKSR1Q969H4 720 aa18.02■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP18.02■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 GJB4Q9NTQ9 266 aa18.02■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 TMOD4Q9NZQ9 345 aa18.02■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 SLFN13Q68D06 897 aa18.02■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 GALNT17Q6IS24 598 aa18.02■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 TSGA10Q9BZW7 698 aa18.02■□□□□ 0.48
EHD3-201ENST00000322054 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms