RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STAG2Q8N3U4 1231 aa25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC17Q96LX7 622 aa25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBSNQ9H1K0 784 aa25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAD17O75943 681 aa25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CACNB3P54284 484 aa25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPAQ15257 358 aa25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLSTN2Q9H4D0 955 aa25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP6R2O75170 966 aa25.2■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMARCA1P28370 1054 aa25.2■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT2P35908 639 aa25.2■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SH3GLB2Q9NR46 395 aa25.2■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HDAC9Q9UKV0 1011 aa25.2■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYH4Q9Y623 1939 aa25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NR5A1Q13285 461 aa25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FUCA2Q9BTY2 467 aa25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPZ1Q9BXG8 430 aa25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PANK2Q9BZ23 570 aa25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAJC18Q9H819 358 aa25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPDYE6P0CI01 402 aa25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM160A1Q05DH4 1040 aa25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCP10Q12799 353 aa25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPY5RQ15761 445 aa25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 JMYQ8N9B5 988 aa25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ENGASEQ8NFI3 743 aa25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OXER1Q8TDS5 423 aa25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP3K11Q16584 847 aa25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTLL1O95922 423 aa25.17■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC35G1Q2M3R5 365 aa25.17■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OGFOD1Q8N543 542 aa25.17■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FSIP1Q8NA03 581 aa25.17■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNMDQ9H2S6 317 aa25.17■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLRF2D3W0D1 207 aa25.16■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYTH3O43739 400 aa25.16■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.16■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNFRSF25Q93038 417 aa25.16■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.16■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNHG28P0DPA3 235 aa25.16■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TATDN1Q6P1N9 297 aa25.16■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CALML3P27482 149 aa25.15■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.15■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.15■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NFKBIEO00221 500 aa25.14■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTAGE5O15320 804 aa25.14■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDHBP11177 359 aa25.14■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CMA1P23946 247 aa25.14■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTGER2P43116 358 aa25.14■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CXCL9Q07325 125 aa25.14■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DLGAP5Q15398 846 aa25.14■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ASPRV1Q53RT3 343 aa25.13■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA8HP0CJ92 632 aa25.13■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NLRP5P59047 1200 aa25.13■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAMK4Q16566 473 aa25.13■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.13■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP17L2Q6R6M4 530 aa25.13■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.13■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CABP5Q9NP86 173 aa25.13■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP17L5A8MUK1 530 aa25.12■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KINO60870 393 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC192P0DO97 292 aa25.12■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MMP14P50281 582 aa25.12■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RASGRP2Q7LDG7 609 aa25.12■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 JDP2Q8WYK2 163 aa25.12■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.12■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP131Q9UPN4 1083 aa25.12■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTMR7Q9Y216 660 aa25.12■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CUTAO60888 179 aa25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms