RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 USP17L24Q0WX57 530 aa26.41■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26.41■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 CTNNA3Q9UI47 895 aa26.41■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 RLFQ13129 1914 aa26.41■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 NEDD4P46934 1319 aa26.41■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 MYH4Q9Y623 1939 aa26.41■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 MFSD6Q6ZSS7 791 aa26.4■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 LPAR1Q92633 364 aa26.4■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 ERO1AQ96HE7 468 aa26.4■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 SH2D4AQ9H788 454 aa26.4■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 TSPY2A6NKD2 308 aa26.39■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 PEX10O60683 326 aa26.39■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 PCP11498 1178 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 HERVK_113P62684 666 aa26.39■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 SPICE1Q8N0Z3 855 aa26.39■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa26.39■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 MCOLN1Q9GZU1 580 aa26.39■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 RBPJLQ9UBG7 517 aa26.39■■□□□ 1.82
SYF2-201ENST00000236273 TTLL1O95922 423 aa26.39■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 CYP21A2P08686 494 aa26.39■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 OTOP1Q7RTM1 612 aa26.39■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 TXNRD2Q9NNW7 524 aa26.39■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.39■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 F5H6K3 240 aa26.38■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 KLRC3Q07444 240 aa26.38■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 TNS4Q8IZW8 715 aa26.38■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa26.38■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 HTTP42858 3142 aa26.38■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 CDC45O75419 566 aa26.37■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 FAM110CQ1W6H9 321 aa26.37■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 TOMM22Q9NS69 142 aa26.37■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 MORF4L1Q9UBU8 362 aa26.37■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 CNMDO75829 334 aa26.36■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 Q3C1V9 767 aa26.36■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 LBX2Q6XYB7 198 aa26.36■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 TRIM47Q96LD4 638 aa26.36■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 GOPCQ9HD26 462 aa26.36■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa26.36■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 TRIM17Q9Y577 477 aa26.36■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 PARP14Q460N5 1801 aa26.35■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 WDR46O15213 610 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 NDUFB10O96000 172 aa26.35■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 RCSD1Q6JBY9 416 aa26.35■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 EFCC1Q9HA90 598 aa26.35■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 MGAMO43451 1857 aa26.34■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 PSMC4P43686 418 aa26.34■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 COG2Q14746 738 aa26.34■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 DOCK3Q8IZD9 2030 aa26.34■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa26.34■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 B4E1Z4 1266 aa26.33■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 FAM83BQ5T0W9 1011 aa26.33■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 ESR2Q92731 530 aa26.33■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 ZSWIM5Q9P217 1185 aa26.33■■□□□ 1.81
SYF2-201ENST00000236273 KDM4AO75164 1064 aa26.32■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 DSG3P32926 999 aa26.32■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 NECTIN1Q15223 517 aa26.32■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 STOX1Q6ZVD7 989 aa26.32■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 TANGO6Q9C0B7 1094 aa26.32■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 FBXO28Q9NVF7 368 aa26.32■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 HOXC10Q9NYD6 342 aa26.32■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 BTBD7Q9P203 1132 aa26.32■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa26.32■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 STX8Q9UNK0 236 aa26.32■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 NT5C2P49902 561 aa26.31■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.31■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 PTPN22Q9Y2R2 807 aa26.31■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa26.31■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 ERVK-9P63128 1117 aa26.3■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 ERVK-24P63145 666 aa26.3■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 KIF22Q14807 665 aa26.3■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa26.3■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa26.3■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 TMEM47Q9BQJ4 181 aa26.3■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa26.3■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 ANO2Q9NQ90 1003 aa26.3■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 RAD21O60216 631 aa26.29■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 FLOT1O75955 427 aa26.29■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 SLFN13Q68D06 897 aa26.29■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 RASGRP2Q7LDG7 609 aa26.29■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 ATG4CQ96DT6 458 aa26.29■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 TTC14Q96N46 770 aa26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms