RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000005558.8

IFRD1-201, Transcript of interferon related developmental regulator 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IFRD1, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1-201ENST00000005558 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.25■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.24■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 USP17L5A8MUK1 530 aa22.24■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 DLK2Q6UY11 383 aa22.24■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.24■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.24■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 NYAP2Q9P242 653 aa22.24■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 GLTPD2A6NH11 291 aa22.24■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 CYTH3O43739 400 aa22.24■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 CDKL5O76039 1030 aa22.24■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.24■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 A0A1W2PRG0 241 aa22.23■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 PDHBP11177 359 aa22.23■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.23■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.23■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.23■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.22■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.22■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 MCM4P33991 863 aa22.22■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 GUCY1B3Q02153 619 aa22.22■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 RESTQ13127 1097 aa22.22■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 CPVLQ9H3G5 476 aa22.22■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 SCN4AP35499 1836 aa22.22■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 CAP2P40123 477 aa22.22■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 FERMT3Q86UX7 667 aa22.22■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 ALG1Q9BT22 464 aa22.22■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.22■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 MTMR7Q9Y216 660 aa22.22■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 WDR90Q96KV7 1748 aa22.21■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.21■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.21■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.21■■□□□ 1.15
IFRD1-201ENST00000005558 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.2■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 FZD1Q9UP38 647 aa22.2■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 ICA1Q05084 483 aa22.2■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.2■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 C8orf76Q96K31 380 aa22.2■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 KIF5BP33176 963 aa22.19■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 RGS22Q8NE09 1264 aa22.19■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 ACER1Q8TDN7 264 aa22.19■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.19■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.19■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 KIF28PB7ZC32 967 aa22.18■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 DEXIO95424 95 aa22.18■■□□□ 1.14
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IFRD1-201ENST00000005558 KRT40Q6A162 431 aa22.18■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 KLRF2D3W0D1 207 aa22.17■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 EPHX2P34913 555 aa22.17■■□□□ 1.14
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IFRD1-201ENST00000005558 ZNF543Q08ER8 600 aa22.17■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 KIF3AQ9Y496 699 aa22.17■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.17■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 CABP5Q9NP86 173 aa22.17■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 ADM5C9JUS6 153 aa22.16■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 H3BQV1 296 aa22.16■■□□□ 1.14
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IFRD1-201ENST00000005558 NPY5RQ15761 445 aa22.16■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 IFFO2Q5TF58 517 aa22.16■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.16■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.16■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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IFRD1-201ENST00000005558 ADAMTS3O15072 1205 aa22.15■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 GNAQP50148 359 aa22.15■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
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IFRD1-201ENST00000005558 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.15■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.15■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.15■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 F5H6K3 240 aa22.15■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 SMARCA1P28370 1054 aa22.15■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 KLRC3Q07444 240 aa22.15■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 NBR1Q14596 966 aa22.15■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.15■■□□□ 1.14
IFRD1-201ENST00000005558 GBP4Q96PP9 640 aa22.15■■□□□ 1.14
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