RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 TBC1D7Q9P0N9 293 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 IGKV5-2P06315 115 aa23.14■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 ADD2P35612 726 aa23.14■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 PRKG1Q13976 671 aa23.14■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.14■■□□□ 1.3
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PTPRJ-208ENST00000615445 DPH6Q7L8W6 267 aa23.14■■□□□ 1.3
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PTPRJ-208ENST00000615445 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRJ-208ENST00000615445 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.12■■□□□ 1.29
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PTPRJ-208ENST00000615445 CYP26C1Q6V0L0 522 aa23.12■■□□□ 1.29
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PTPRJ-208ENST00000615445 FNBP1Q96RU3 617 aa23.12■■□□□ 1.29
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PTPRJ-208ENST00000615445 RASAL2Q9UJF2 1139 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRJ-208ENST00000615445 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
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PTPRJ-208ENST00000615445 CEP83Q9Y592 693 aa23.09■■□□□ 1.29
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PTPRJ-208ENST00000615445 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
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PTPRJ-208ENST00000615445 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
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PTPRJ-208ENST00000615445 CNKSR1Q969H4 720 aa23.08■■□□□ 1.29
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PTPRJ-208ENST00000615445 STK24Q9Y6E0 443 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRJ-208ENST00000615445 LCORLQ8N3X6 602 aa23.08■■□□□ 1.28
PTPRJ-208ENST00000615445 IFT81Q8WYA0 676 aa23.08■■□□□ 1.28
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