RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 ALG1Q9BT22 464 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 ATRNL1Q5VV63 1379 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM83AQ86UY5 434 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 MYL10Q9BUA6 226 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 FZD9O00144 591 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAK2O60296 914 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 RXRAP19793 462 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 CDC27P30260 824 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 TCP10Q12799 353 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 TROAPQ12815 778 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 NFIAQ12857 509 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 CDC37L1Q7L3B6 337 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 BRAPQ7Z569 592 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 SENP2Q9HC62 589 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 MYOZ2Q9NPC6 264 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM198AQ9UFP1 575 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF3CO14782 793 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC44A5Q8NCS7 719 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 H7C1D1 291 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 NTRK3Q16288 839 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 NKX2-3Q8TAU0 364 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 HOOK2Q96ED9 719 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 BRMS1Q9HCU9 246 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 CABP5Q9NP86 173 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 MYH8P13535 1937 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 SMIM22K7EJ46 135 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 TTLL1O95922 423 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 RASSF7Q02833 373 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 TMTC3Q6ZXV5 915 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM87AQ8NBN3 555 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 IL17RBQ9NRM6 502 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 FDPSP14324 419 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 GRM4Q14833 912 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 RCSD1Q6JBY9 416 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 CSRNP1Q96S65 589 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM47Q9BQJ4 181 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 VEZTQ9HBM0 779 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 COL4A5P29400 1685 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-212ENST00000591041 NMT2O60551 498 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 SMARCA1P28370 1054 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 APLP1P51693 650 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM179Q6ZVK1 233 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 PHKBQ93100 1093 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 KANSL2Q9H9L4 492 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 MTMR4Q9NYA4 1195 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 SHMT1P34896 483 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 NOVP48745 357 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 CACNB3P54284 484 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 EVX2Q03828 476 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 RESTQ13127 1097 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 KLHL40Q2TBA0 621 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 FERMT3Q86UX7 667 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP95Q96GE4 821 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 GPC2Q8N158 579 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 CLRN2A0PK11 232 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 ASPRV1Q53RT3 343 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 TATDN1Q6P1N9 297 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 LMBRD1Q9NUN5 540 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 ELP1O95163 1332 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 TBC1D12O60347 775 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 AKR1B1P15121 316 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCB5Q2M3G0 1257 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 NBPF11Q86T75 865 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 MICALL2Q8IY33 904 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 WNT10BO00744 389 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 TOMM70O94826 608 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 FOSBP53539 338 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE2HP62256 183 aa26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.6 ms