RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-208	ENST00000497842	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	NMT2	O60551	498 aa		33.47	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	CAP2	P40123	477 aa		33.47	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		33.47	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	DGKH	Q86XP1	1220 aa		33.47	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	DOCK1	Q14185	1865 aa		33.46	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	DLK2	Q6UY11	383 aa		33.46	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	CEP95	Q96GE4	821 aa		33.46	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	33.46	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	GINM1	Q9NU53	330 aa		33.46	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		33.46	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	MYH4	Q9Y623	1939 aa		33.45	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		33.45	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC69	A6NI79	296 aa		33.45	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	GH2	P01242	217 aa		33.45	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		33.45	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	ANKS1A	Q92625	1134 aa		33.45	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	33.45	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		33.45	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	APOBR	Q0VD83	1088 aa		33.44	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		33.44	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		33.44	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	STX8	Q9UNK0	236 aa		33.44	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	ASNS	P08243	561 aa		33.43	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	WRNIP1	Q96S55	665 aa		33.43	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		33.43	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	EVC	P57679	992 aa		33.42	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	SEPT2	Q15019	361 aa		33.42	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		33.42	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		33.42	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		33.42	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		33.42	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		33.41	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	TTLL1	O95922	423 aa		33.41	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	KAT14	Q9H8E8	782 aa		33.41	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		33.41	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	NOV	P48745	357 aa		33.4	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	PRKG1	Q13976	671 aa		33.4	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	SENP2	Q9HC62	589 aa		33.4	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		33.4	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		33.39	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	TRAF5	O00463	557 aa		33.39	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	INPP5B	P32019	993 aa		33.39	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	GUCY1A2	P33402	732 aa		33.39	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	VEGFB	P49765	207 aa		33.39	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	JAG1	P78504	1218 aa		33.39	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	ICA1	Q05084	483 aa		33.39	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		33.39	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	NYAP2	Q9P242	653 aa		33.39	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		33.39	■■■□□ 2.94
TTC19-208	ENST00000497842	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	TMX3	Q96JJ7	454 aa		33.38	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		33.38	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		33.38	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	OTOF	Q9HC10	1997 aa		33.37	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	33.37	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	33.37	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	ATP2B2	Q01814	1243 aa		33.37	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	APOA5	Q6Q788	366 aa		33.37	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		33.37	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		33.37	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	33.37	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		33.37	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	PICK1	Q9NRD5	415 aa		33.37	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		33.37	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	33.37	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	FZD1	Q9UP38	647 aa		33.37	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		33.36	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	MAP3K9	P80192	1104 aa		33.36	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		33.36	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		33.36	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	ZBTB43	O43298	467 aa		33.35	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	RCAN1	P53805	252 aa		33.35	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	ME3	Q16798	604 aa		33.35	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	PNMA1	Q8ND90	353 aa		33.35	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		33.35	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		33.35	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	CALM1	P0DP23	149 aa		33.34	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	CALM2	P0DP24	149 aa		33.34	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	CALM3	P0DP25	149 aa		33.34	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	CSAD	Q9Y600	493 aa		33.34	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	DDAH1	O94760	285 aa		33.34	■■■□□ 2.93
TTC19-208	ENST00000497842	MAP3K11	Q16584	847 aa		33.34	■■■□□ 2.93

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