RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 CATIPQ7Z7H3 387 aa25.81■■□□□ 1.72
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PSPC1-204ENST00000492741 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25.81■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.81■■□□□ 1.72
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PSPC1-204ENST00000492741 ZBTB43O43298 467 aa25.8■■□□□ 1.72
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PSPC1-204ENST00000492741 POTEJP0CG39 1038 aa25.8■■□□□ 1.72
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PSPC1-204ENST00000492741 ATP2B2Q01814 1243 aa25.8■■□□□ 1.72
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PSPC1-204ENST00000492741 MICU3Q86XE3 530 aa25.8■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 MTMR4Q9NYA4 1195 aa25.8■■□□□ 1.72
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PSPC1-204ENST00000492741 NUP133Q8WUM0 1156 aa25.8■■□□□ 1.72
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PSPC1-204ENST00000492741 SEPT2Q15019 361 aa25.79■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF654Q8IZM8 581 aa25.79■■□□□ 1.72
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PSPC1-204ENST00000492741 PNMA1Q8ND90 353 aa25.77■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 GTF3C6Q969F1 213 aa25.77■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.77■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 CDCA5Q96FF9 252 aa25.77■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 MTMR7Q9Y216 660 aa25.77■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
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PSPC1-204ENST00000492741 WRNIP1Q96S55 665 aa25.76■■□□□ 1.71
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PSPC1-204ENST00000492741 CALM3P0DP25 149 aa25.75■■□□□ 1.71
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PSPC1-204ENST00000492741 ST3GAL1Q11201 340 aa25.72■■□□□ 1.71
PSPC1-204ENST00000492741 TROAPQ12815 778 aa25.72■■□□□ 1.71
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PSPC1-204ENST00000492741 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.71■■□□□ 1.71
PSPC1-204ENST00000492741 RAD21O60216 631 aa25.71■■□□□ 1.71
PSPC1-204ENST00000492741 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
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PSPC1-204ENST00000492741 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PSPC1-204ENST00000492741 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
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PSPC1-204ENST00000492741 ADD1P35611 737 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PSPC1-204ENST00000492741 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PSPC1-204ENST00000492741 PICK1Q9NRD5 415 aa25.71■■□□□ 1.71
PSPC1-204ENST00000492741 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PSPC1-204ENST00000492741 PPP2R5BQ15173 497 aa25.7■■□□□ 1.7
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.7■■□□□ 1.7
PSPC1-204ENST00000492741 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
PSPC1-204ENST00000492741 TRAF5O00463 557 aa25.69■■□□□ 1.7
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