RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490639.5

CP-212, Transcript of ceruloplasmin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CP, Length 3,105 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CP-212ENST00000490639 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 HOOK2Q96ED9 719 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 LRRC2Q9BYS8 371 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 KRT23Q9C075 422 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 SENP2Q9HC62 589 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 BRCA2P51587 3418 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 TSPY2A6NKD2 308 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 TSPY3P0CV98 308 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 TSPY8P0CW00 308 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 NF2P35240 595 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 KRT32Q14532 448 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 SEPT2Q15019 361 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 RUFY3Q7L099 469 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 NEDD1Q8NHV4 660 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 ESR2Q92731 530 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 CEP95Q96GE4 821 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 RPS6KB1P23443 525 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 NOVP48745 357 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 MAP3K9P80192 1104 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 SCYL3Q8IZE3 742 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 TM6SF1Q9BZW5 370 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.39□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 SMCHD1A6NHR9 2005 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 A0A1W2PRG0 241 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 PRC1O43663 620 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 PTPRAP18433 802 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 ECE1P42892 770 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 TRDNQ13061 729 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 DGKZQ13574 1117 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 SEC23AQ15436 765 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 TMEM179Q6ZVK1 233 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 CCDC17Q96LX7 622 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 TTC14Q96N46 770 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 ELP3Q9H9T3 547 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 TNKSO95271 1327 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 HTTP42858 3142 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 MCM5P33992 734 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 GJA5P36382 358 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 FKBP1BP68106 108 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 LY9Q9HBG7 655 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.38□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 GABBR2O75899 941 aa6.37□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 ASNSP08243 561 aa6.37□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 EEF2P13639 858 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa6.37□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 Q6ZUG5 572 aa6.37□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 ACER1Q8TDN7 264 aa6.37□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.37□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.37□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 WDR19Q8NEZ3 1342 aa6.37□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.37□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 PSMA5P28066 241 aa6.37□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 ICA1Q05084 483 aa6.37□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.37□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.37□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 TTLL1O95922 423 aa6.36□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 NEK4P51957 841 aa6.36□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 HUNKP57058 714 aa6.36□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 HTRA3P83110 453 aa6.36□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 IQCA1Q86XH1 822 aa6.36□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 FBXL16Q8N461 479 aa6.36□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 OPTNQ96CV9 577 aa6.36□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.36□□□□□ -1.39
CP-212ENST00000490639 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms