RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-208ENST00000469529 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
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TRAF4-208ENST00000469529 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAF4-208ENST00000469529 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAF4-208ENST00000469529 SENP2Q9HC62 589 aa14.92□□□□□ -0.02
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TRAF4-208ENST00000469529 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.91□□□□□ -0.02
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TRAF4-208ENST00000469529 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.91□□□□□ -0.02
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TRAF4-208ENST00000469529 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.91□□□□□ -0.02
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TRAF4-208ENST00000469529 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
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TRAF4-208ENST00000469529 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.9□□□□□ -0.02
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TRAF4-208ENST00000469529 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 NMT2O60551 498 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 CDKL5O76039 1030 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 CTDNEP1O95476 244 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 TTLL1O95922 423 aa14.89□□□□□ -0.03
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TRAF4-208ENST00000469529 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
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TRAF4-208ENST00000469529 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.89□□□□□ -0.03
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TRAF4-208ENST00000469529 CEP95Q96GE4 821 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 KAT14Q9H8E8 782 aa14.89□□□□□ -0.03
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TRAF4-208ENST00000469529 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 LAMB1P07942 1786 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.88□□□□□ -0.03
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TRAF4-208ENST00000469529 CAP2P40123 477 aa14.88□□□□□ -0.03
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TRAF4-208ENST00000469529 DCAF15Q66K64 600 aa14.88□□□□□ -0.03
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TRAF4-208ENST00000469529 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
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TRAF4-208ENST00000469529 MYH1P12882 1939 aa14.88□□□□□ -0.03
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TRAF4-208ENST00000469529 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 SNHG28P0DPA3 235 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 KIF5BP33176 963 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 GUCY1A2P33402 732 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 STK3Q13188 491 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 CREBZFQ9NS37 354 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 GGA3Q9NZ52 723 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 STX8Q9UNK0 236 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 ASNSP08243 561 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 FDPSP14324 419 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 CDC27P30260 824 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 FUT2Q10981 343 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 GRM4Q14833 912 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 RTN1Q16799 776 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 STK36Q9NRP7 1315 aa14.86□□□□□ -0.03
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TRAF4-208ENST00000469529 BRD1O95696 1058 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 GJB2P29033 226 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 JAG1P78504 1218 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 CLEC17AQ6ZS10 378 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 MICU3Q86XE3 530 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 SULF1Q8IWU6 871 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 JMYQ8N9B5 988 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAF4-208ENST00000469529 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.85□□□□□ -0.03
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