RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372405.1

PTPRF-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRF, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-202ENST00000372405 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
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PTPRF-202ENST00000372405 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
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PTPRF-202ENST00000372405 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
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PTPRF-202ENST00000372405 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
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PTPRF-202ENST00000372405 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-202ENST00000372405 CCDC183Q5T5S1 534 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-202ENST00000372405 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
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PTPRF-202ENST00000372405 NR5A1Q13285 461 aa15.93■□□□□ 0.14
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