RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 PAK2Q13177 524 aa17.36■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 RAPGEF1Q13905 1077 aa17.36■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 PPP2R5AQ15172 486 aa17.36■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 E2F5Q15329 346 aa17.36■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 FAM71BQ8TC56 605 aa17.36■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 DCAF5Q96JK2 942 aa17.36■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa17.36■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 PRPHP41219 470 aa17.36■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 GYS2P54840 703 aa17.36■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 GSTA5Q7RTV2 222 aa17.36■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa17.36■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa17.36■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 CHD1O14646 1710 aa17.36■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 NEDD9Q14511 834 aa17.35■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa17.35■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 DSCC1Q9BVC3 393 aa17.35■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 LRRC27Q9C0I9 530 aa17.35■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 EFCC1Q9HA90 598 aa17.35■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 MED4Q9NPJ6 270 aa17.35■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 CLTAP09496 248 aa17.35■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 SEPT6Q14141 434 aa17.35■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 TRIM68Q6AZZ1 485 aa17.35■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 ADGRB3O60242 1522 aa17.35■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 KMT5BQ4FZB7 885 aa17.35■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa17.35■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 BLZF1Q9H2G9 400 aa17.35■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 FAM114A2Q9NRY5 505 aa17.35■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 SAMM50Q9Y512 469 aa17.35■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 TBCAO75347 108 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 IGKV5-2P06315 115 aa17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 TRIM14Q14142 442 aa17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 POSTNQ15063 836 aa17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 CNNM2Q9H8M5 875 aa17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 CARMIL3Q8ND23 1372 aa17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 CEP104O60308 925 aa17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 RILPL1Q5EBL4 403 aa17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 KCTD16Q68DU8 428 aa17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 TBC1D31Q96DN5 1066 aa17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 ITGA6P23229 1130 aa17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 PDE4BQ07343 736 aa17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 DDX12PQ92771 950 aa17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 MAST3O60307 1309 aa17.34■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 ATP2A1O14983 1001 aa17.33■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 LINC00301Q8NCQ3 95 aa17.33■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 COPRSQ9NQ92 184 aa17.33■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 MLH3Q9UHC1 1453 aa17.33■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 M0R2C6 588 aa17.33■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa17.33■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa17.33■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa17.33■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 V9GY48 417 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.37
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF532Q9HCE3 1301 aa17.33■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 ICE2Q659A1 982 aa17.33■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 DTHD1Q6ZMT9 781 aa17.33■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC63Q8NA47 563 aa17.33■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 OSBP2Q969R2 916 aa17.33■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 WWC3Q9ULE0 1092 aa17.33■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 VPS54Q9P1Q0 977 aa17.33■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 PLA2G4DQ86XP0 818 aa17.32■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 EFCAB13Q8IY85 973 aa17.32■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 EXOC4Q96A65 974 aa17.32■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 NOX5Q96PH1 765 aa17.32■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 ODF2LQ9ULJ1 636 aa17.32■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 CUTAO60888 179 aa17.32■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 PPFIA4O75335 1185 aa17.32■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 KRT2P35908 639 aa17.32■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa17.31■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF131P52739 623 aa17.31■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 IFT88Q13099 833 aa17.31■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 VCXQ9H320 206 aa17.31■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 RTEL1Q9NZ71 1219 aa17.31■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 TRAF5O00463 557 aa17.31■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 ZMYND10O75800 440 aa17.31■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 CMA1P23946 247 aa17.31■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 GBP1P32455 592 aa17.31■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 CRB1P82279 1406 aa17.31■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 ATP8B1O43520 1251 aa17.31■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 CFAP221Q4G0U5 840 aa17.31■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa17.31■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 EEF2P13639 858 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 PAK1Q13153 545 aa17.3■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 MCUR1Q96AQ8 359 aa17.3■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa17.3■□□□□ 0.36
KCNS1-201ENST00000306117 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms