RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.84■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.84■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.84■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 KINO60870 393 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 PLEKHA8P1O95397 391 aa24.83■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 HS1BP3Q53T59 392 aa24.83■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 CKAP2LQ8IYA6 745 aa24.83■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SNRNP25-201ENST00000293861 MYH8P13535 1937 aa24.83■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa24.82■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 BTBD18B2RXH4 712 aa24.82■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 JMYQ8N9B5 988 aa24.82■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.82■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 KCNJ14Q9UNX9 436 aa24.82■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 CMA1P23946 247 aa24.82■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.82■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.82■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.82■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 RASA1P20936 1047 aa24.81■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 KIF5BP33176 963 aa24.81■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 SASS6Q6UVJ0 657 aa24.81■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.81■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 MRIQ9BWK5 157 aa24.81■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 KAT14Q9H8E8 782 aa24.81■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 F8W031 263 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 CAVIN2O95810 425 aa24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 TSPY3P0CV98 308 aa24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 TSPY8P0CW00 308 aa24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 RILPL1Q5EBL4 403 aa24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 TEKT1Q969V4 418 aa24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 PHF20Q9BVI0 1012 aa24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 ECE2O60344 883 aa24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 CDK8P49336 464 aa24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.79■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 MXD3Q9BW11 206 aa24.79■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 A0A1B0GVL5 298 aa24.78■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.78■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 PNMA1Q8ND90 353 aa24.78■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 SHISA4Q96DD7 197 aa24.78■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa24.78■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa24.78■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 NDUFA8P51970 172 aa24.78■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 SCN9AQ15858 1988 aa24.77■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 DACT2Q5SW24 774 aa24.77■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.77■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SNRNP25-201ENST00000293861 CUTAO60888 179 aa24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 SCNN1DP51172 638 aa24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 GRM4Q14833 912 aa24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 USP40Q9NVE5 1235 aa24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 VPS54Q9P1Q0 977 aa24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 USP17L3A6NCW0 530 aa24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 USP17L4A6NCW7 530 aa24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 GNAQP50148 359 aa24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 NR5A1Q13285 461 aa24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 ANO6Q4KMQ2 910 aa24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 TTLL6Q8N841 843 aa24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 ZDHHC15Q96MV8 337 aa24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 ESPNB1AK53 854 aa24.75■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 KRT2P35908 639 aa24.75■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 CRKP46108 304 aa24.75■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 OXER1Q8TDS5 423 aa24.75■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 TIGD1Q96MW7 591 aa24.75■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 HPSEQ9Y251 543 aa24.75■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 SCG2P13521 617 aa24.74■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 NOVP48745 357 aa24.74■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 AOC3Q16853 763 aa24.74■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa24.74■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 KCNQ5Q9NR82 932 aa24.74■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 USP25Q9UHP3 1055 aa24.74■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.74■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 PFKFB1P16118 471 aa24.74■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 PICALMQ13492 652 aa24.74■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 PSME4Q14997 1843 aa24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF202O95125 648 aa24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 GABPAQ06546 454 aa24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC93Q567U6 631 aa24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 RESP18Q5W5W9 173 aa24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC125Q86Z20 511 aa24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 BRMS1Q9HCU9 246 aa24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25-201ENST00000293861 C21orf2O43822 256 aa24.73■■□□□ 1.55
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