RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pde4aO89084 844 aa26.67■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vcam1P29533 739 aa26.67■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gpr162Q3UN16 588 aa26.67■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Borcs6Q9D6W8 360 aa26.67■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mx2Q9WVP9 655 aa26.67■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dcdc2bF7BCK0 340 aa26.66■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Stx1aO35526 288 aa26.66■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Wnt10bP48614 389 aa26.66■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cep131Q62036 1060 aa26.66■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Polr3gQ6NXY9 223 aa26.66■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vmn2r68L7N2B3 851 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 NyxP83503 476 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 QarsQ8BML9 775 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mei1Q9D4I2 1268 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ltbp2O08999 1813 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tbc1d8bA3KGB4 1114 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 LdhdQ7TNG8 484 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kbtbd13Q8C828 458 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cdk8Q8R3L8 464 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lrrc2Q8VDB8 371 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pcdhb15Q91Y04 786 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tgm5Q9D7I9 724 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 NinQ61043 2035 aa26.64■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pramel3A2AHA7 463 aa26.64■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm7903A2AWL1 463 aa26.64■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 AV320801A2AWL3 467 aa26.64■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm15023L7MUB4 467 aa26.64■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 NogP97466 232 aa26.64■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tbc1d31Q6NXY1 996 aa26.64■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 KhnynQ80U38 671 aa26.64■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tbc1d5Q80XQ2 815 aa26.64■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Shtn1Q8K2Q9 631 aa26.64■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atxn7Q8R4I1 867 aa26.64■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nop2Q922K7 793 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mindy4Q3UQI9 744 aa26.63■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nup133Q8R0G9 1155 aa26.63■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gtf2a1Q99PM3 378 aa26.63■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dusp10Q9ESS0 483 aa26.63■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Akap2O54931 893 aa26.63■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mmp14P53690 582 aa26.63■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Epha2Q03145 977 aa26.63■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmc4Q7TQ65 694 aa26.63■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Glis2Q8VDL9 521 aa26.63■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppil2Q9D787 521 aa26.63■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Brpf3B2KF05 1204 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ampd3O08739 766 aa26.62■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pank2Q3U4S0 443 aa26.62■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kif1bpQ6ZPU9 617 aa26.62■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q8K2W9 541 aa26.62■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eif4enif1Q9EST3 983 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sec62Q8BU14 398 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trappc12Q8K2L8 797 aa26.62■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 NenfQ9CQ45 171 aa26.62■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nmt2O70311 529 aa26.61■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc27a3O88561 667 aa26.61■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Calm1P0DP26 149 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ftl1P29391 183 aa26.61■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Stk39Q9Z1W9 556 aa26.61■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 NrapQ80XB4 1728 aa26.61■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bcorl1A2AQH4 1781 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ces1hD3Z298 562 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PaoxQ8C0L6 504 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pus7lQ8CE46 702 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hnrnpul1Q8VDM6 859 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Plxnb2B2RXS4 1842 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 MyrflQ3UN70 904 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tbc1d9bQ5SVR0 1263 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Oxsr1Q6P9R2 527 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nop14Q8R3N1 860 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Acot9Q9R0X4 439 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Klrc1Q9Z202 244 aa26.6■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Znf638Q61464 1960 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prss51A0A286YDY8 319 aa26.59■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Epb41l2O70318 988 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Myo1bP46735 1107 aa26.59■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ascc2Q91WR3 749 aa26.59■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Stk32bQ9JJX8 414 aa26.59■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Usp53P15975 1069 aa26.59■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rc3h1Q4VGL6 1130 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmtc2Q56A06 836 aa26.59■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tnip1Q9WUU8 647 aa26.59■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zscan20B2KFW1 1030 aa26.58■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cavin1O54724 392 aa26.58■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ptpn12P35831 775 aa26.58■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cnot7Q60809 285 aa26.58■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Amer1Q7TS75 1132 aa26.58■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hps3Q91VB4 1002 aa26.58■■□□□ 1.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Oog3Q3UWY1 500 aa26.57■■□□□ 1.84
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zfp202Q8C879 641 aa26.57■■□□□ 1.84
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cep89Q9CZX2 791 aa26.57■■□□□ 1.84
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prr16A3KMN5 304 aa26.57■■□□□ 1.84
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bach1P97302 739 aa26.57■■□□□ 1.84
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eya3P97480 510 aa26.57■■□□□ 1.84
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Traf3ip1Q149C2 625 aa26.57■■□□□ 1.84
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tekt3Q6X6Z7 490 aa26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.5 ms