RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	BCL9	O00512	1426 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	CRB1	P82279	1406 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	PIK3C2A	O00443	1686 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	ABL1	P00519	1130 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	EDN3	P14138	238 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	ITGB7	P26010	798 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	AAMP	Q13685	434 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	DYRK3	O43781	588 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	NOS3	P29474	1203 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGAP4	P98171	946 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	KIF1B	O60333	1816 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768		A6NHS1	94 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768		F8W735	103 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	PHACTR2	O75167	634 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	7.47	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	ARID3A	Q99856	593 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		7.46	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	FAM177B	A6PVY3	158 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	EREG	O14944	169 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	NEFL	P07196	543 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	SERPINB4	P48594	390 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	SLC51A	Q86UW1	340 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	NXPE3	Q969Y0	559 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	SOX13	Q9UN79	622 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	CNTNAP1	P78357	1384 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	USP6	P35125	1406 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768		H3BRB1	525 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768		H3BRJ5	948 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	LINC01387	J3KSC0	135 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	FSCN2	O14926	492 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	EPHA1	P21709	976 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	SOX10	P56693	466 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	FAM129B	Q96TA1	746 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	PPL	O60437	1756 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	BRD1	O95696	1058 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	CABP4	P57796	275 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	BSND	Q8WZ55	320 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	TP53INP1	Q96A56	240 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	OSMR	Q99650	979 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	NDUFB5	O43674	189 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	SMIM5	Q71RC9	77 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	RNF181	Q9P0P0	153 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	ABCC11	Q96J66	1382 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	IGHA2	P01877	340 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MLH1-223	ENST00000616768	ACPP	P15309	386 aa		7.42	□□□□□ -1.22

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