RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606161.1

ZEB1-224, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 1, human

TSL 3

Gene ZEB1, Length 482 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB1-224	ENST00000606161	FYB2	Q5VWT5	728 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	RIN3	Q8TB24	985 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	GIPC2	Q8TF65	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	ASB11	Q8WXH4	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	SPG7	Q9UQ90	795 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	TCF3	P15923	654 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	CAP2	P40123	477 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	CLCN7	P51798	805 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	SV2B	Q7L1I2	683 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	UNCX	A6NJT0	531 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	FGD1	P98174	961 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	ATP2B2	Q01814	1243 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	SEPT6	Q14141	434 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	KCT2	Q8NC54	265 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	MIPEP	Q99797	713 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	FOXQ1	Q9C009	403 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	GFRA2	O00451	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161		H3BS24	57 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	GNA15	P30679	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	GRK4	P32298	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	HDX	Q7Z353	690 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-224	ENST00000606161	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	DBX1	A6NMT0	343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	HID1	Q8IV36	788 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	LIG3	P49916	1009 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	TNK2	Q07912	1038 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	MLANA	Q16655	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	C8orf37	Q96NL8	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	AK5	Q9Y6K8	562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	WASH4P	A8MWX3	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	CBX7	O95931	251 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	KRT1	P04264	644 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	VAMP1	P23763	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	CDH24	Q86UP0	819 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161		Q96M66	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	FRMD6	Q96NE9	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-224	ENST00000606161	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms