RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC17Q96LX7 622 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 TTC14Q96N46 770 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 CPA1P15085 419 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 ANTXR2P58335 489 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 PRC1O43663 620 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 DCAF15Q66K64 600 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 USP48Q86UV5 1035 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 JMYQ8N9B5 988 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 PASKQ96RG2 1323 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 ADM5C9JUS6 153 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 ST18O60284 1047 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 SLURP2P0DP57 97 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 TFAP4Q01664 338 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM87BQ96K49 555 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 TSPY2A6NKD2 308 aa22.05■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 FAM196BA6NMK8 535 aa22.05■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.05■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 IQCA1Q86XH1 822 aa22.05■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.05■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 TSPY3P0CV98 308 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 TSPY8P0CW00 308 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 CHST3Q7LGC8 479 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 SNX21Q969T3 373 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 CDCA5Q96FF9 252 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 GINM1Q9NU53 330 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 AKR1B1P15121 316 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 ANKRD1Q15327 319 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 Q6ZUG5 572 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 ANKS1AQ92625 1134 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 CREBZFQ9NS37 354 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 LIFRP42702 1097 aa22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 NOVP48745 357 aa22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 MCM2P49736 904 aa22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 SEC23AQ15436 765 aa22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 TMTC2Q8N394 836 aa22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-210ENST00000568388 ERICH2A1L162 156 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 NF2P35240 595 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 CAP2P40123 477 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 AK2P54819 239 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 EVCP57679 992 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 DGKHQ86XP1 1220 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 CABP5Q9NP86 173 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 MYH4Q9Y623 1939 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM67Q5HYA8 995 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 DLK2Q6UY11 383 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 SGMS1Q86VZ5 419 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 LRRC2Q9BYS8 371 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 LY9Q9HBG7 655 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 DOCK1Q14185 1865 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 TRPM7Q96QT4 1865 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 TNKSO95271 1327 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 FGD1P98174 961 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-210ENST00000568388 WTAPQ15007 396 aa21.99■■□□□ 1.11
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