RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511191.1

ACTN3-202, Transcript of actinin alpha 3 (gene/pseudogene), humanhuman

TSL 5

Gene ACTN3, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3-202ENST00000511191 MKNK2Q9HBH9 465 aa25.11■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 SLC27A2O14975 620 aa25.1■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 RNF20Q5VTR2 975 aa25.1■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 CREB3L3Q68CJ9 461 aa25.1■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 MFSD6Q6ZSS7 791 aa25.1■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 KCNB2Q92953 911 aa25.1■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 RASSF10A6NK89 507 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 ASNSP08243 561 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 HSPA6P17066 643 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 HSPA4P34932 840 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 JAG1P78504 1218 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 ABCB5Q2M3G0 1257 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 PRDM1O75626 825 aa25.08■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 GDF11O95390 407 aa25.08■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 TSGA10IPQ3SY00 556 aa25.08■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 RGMBQ6NW40 437 aa25.08■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 INCENPQ9NQS7 918 aa25.08■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.08■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 DOCK1Q14185 1865 aa25.08■■□□□ 1.61
ACTN3-202ENST00000511191 PLIN4Q96Q06 1357 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 SEC24BO95487 1268 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 AKR1B1P15121 316 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 CNNM2Q9H8M5 875 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 CABP5Q9NP86 173 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 PICK1Q9NRD5 415 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 NEDD4P46934 1319 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 GH2P01242 217 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 PTPRAP18433 802 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 ERO1BQ86YB8 467 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 ELP3Q9H9T3 547 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 MYH8P13535 1937 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 E7EWF7 191 aa25.05■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 GUCY1A2P33402 732 aa25.05■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 PPATQ06203 517 aa25.05■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 NEDD1Q8NHV4 660 aa25.05■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.05■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 KRT23Q9C075 422 aa25.05■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.04■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 ESR2Q92731 530 aa25.04■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.04■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 USP17L5A8MUK1 530 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 TFAP4Q01664 338 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 RASEFQ8IZ41 740 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 CCDC102AQ96A19 550 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 TOMM22Q9NS69 142 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 SLC10A3P09131 477 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 TSPY3P0CV98 308 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 TSPY8P0CW00 308 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 MCCP23508 829 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 TRDNQ13061 729 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 PPIL2Q13356 520 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 KRT32Q14532 448 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 SEPT2Q15019 361 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 NCOA7Q8NI08 942 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 OPTNQ96CV9 577 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 WNK4Q96J92 1243 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 WDR18Q9BV38 432 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 BACH2Q9BYV9 841 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTN3-202ENST00000511191 TSPY2A6NKD2 308 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 FAM47AQ5JRC9 791 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 SPRYD7Q5W111 196 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 B4E1Z4 1266 aa25■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 KDM4AO75164 1064 aa25■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 GJA5P36382 358 aa25■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 RAB3GAP1Q15042 981 aa25■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 IL17RAQ96F46 866 aa25■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 SNX14Q9Y5W7 946 aa25■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 NOVP48745 357 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms