RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493711.1

SNX17-208, Transcript of sorting nexin 17, humanhuman

TSL 3

Gene SNX17, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17-208ENST00000493711 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SNX17-208ENST00000493711 HAND2P61296 217 aa14.71□□□□□ -0.05
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SNX17-208ENST00000493711 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX17-208ENST00000493711 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SNX17-208ENST00000493711 SMC1BQ8NDV3 1235 aa14.71□□□□□ -0.05
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SNX17-208ENST00000493711 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa14.7□□□□□ -0.06
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SNX17-208ENST00000493711 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
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SNX17-208ENST00000493711 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
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SNX17-208ENST00000493711 TOMM22Q9NS69 142 aa14.69□□□□□ -0.06
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SNX17-208ENST00000493711 MTA3Q9BTC8 594 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX17-208ENST00000493711 NBPF3Q9H094 633 aa14.68□□□□□ -0.06
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SNX17-208ENST00000493711 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.67□□□□□ -0.06
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SNX17-208ENST00000493711 SHMT1P34896 483 aa14.67□□□□□ -0.06
SNX17-208ENST00000493711 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SNX17-208ENST00000493711 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.67□□□□□ -0.06
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SNX17-208ENST00000493711 MAP3K9P80192 1104 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNX17-208ENST00000493711 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNX17-208ENST00000493711 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNX17-208ENST00000493711 NEDD4P46934 1319 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX17-208ENST00000493711 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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SNX17-208ENST00000493711 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX17-208ENST00000493711 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SNX17-208ENST00000493711 PRDM1O75626 825 aa14.64□□□□□ -0.07
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SNX17-208ENST00000493711 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SNX17-208ENST00000493711 GSE1Q14687 1217 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX17-208ENST00000493711 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SNX17-208ENST00000493711 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX17-208ENST00000493711 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SNX17-208ENST00000493711 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX17-208ENST00000493711 TMTC2Q8N394 836 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX17-208ENST00000493711 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX17-208ENST00000493711 TMEM87BQ96K49 555 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX17-208ENST00000493711 WRNIP1Q96S55 665 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX17-208ENST00000493711 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX17-208ENST00000493711 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.64□□□□□ -0.07
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