RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 IL27Q8NEV9 243 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-210ENST00000568388 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-210ENST00000568388 EHD4Q9H223 541 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-210ENST00000568388 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-210ENST00000568388 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-210ENST00000568388 MYH8P13535 1937 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 HLA-DOAP06340 250 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 NT5C2P49902 561 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 POTEIP0CG38 1075 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 POTEJP0CG39 1038 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 PSMA5P28066 241 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 GABPAQ06546 454 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 RASA3Q14644 834 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 GGA3Q9NZ52 723 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 SMIM22K7EJ46 135 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 ORC4O43929 436 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 EVX2Q03828 476 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 PDE4BQ07343 736 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 NCOA7Q8NI08 942 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 TEPSINQ96N21 525 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 NEK1Q96PY6 1258 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 TRDNQ13061 729 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 RABEP1Q15276 862 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 KRT23Q9C075 422 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 SWAP70Q9UH65 585 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 TBC1D12O60347 775 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 CDK8P49336 464 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 MAP3K10Q02779 954 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 CHADLQ6NUI6 762 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 CSRNP1Q96S65 589 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-210ENST00000568388 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 INCENPQ9NQS7 918 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 NEDD4P46934 1319 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 RUFY3Q7L099 469 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 SULF1Q8IWU6 871 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 KLRG1Q96E93 195 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 HOOK2Q96ED9 719 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 LDHDQ86WU2 507 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 ESR2Q92731 530 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 RASA1P20936 1047 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 RPS6KB1P23443 525 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 MCM5P33992 734 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 MTA3Q9BTC8 594 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 DNAJC18Q9H819 358 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 B4E1Z4 1266 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 PRDM1O75626 825 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 SHMT1P34896 483 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 NEK4P51957 841 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 FBXL16Q8N461 479 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 TOMM22Q9NS69 142 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-210ENST00000568388 KDM4AO75164 1064 aa22.09■■□□□ 1.13
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