RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568316.1

RBBP6-211, Transcript of RB binding protein 6, ubiquitin ligase, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP6, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6-211ENST00000568316 NAPBQ9H115 298 aa29.69■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 CASC1Q6TDU7 716 aa29.68■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 AMOTL1Q8IY63 956 aa29.68■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF341Q9BYN7 854 aa29.68■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 CREBZFQ9NS37 354 aa29.68■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 SMIM22K7EJ46 135 aa29.67■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 HSPA6P17066 643 aa29.67■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 HTRA3P83110 453 aa29.67■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa29.67■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 TRIM34Q9BYJ4 488 aa29.67■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP29.67■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 MINDY4BA8MYZ0 360 aa29.66■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 IREB2P48200 963 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 HUNKP57058 714 aa29.66■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 C12orf60Q5U649 245 aa29.66■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 WRNIP1Q96S55 665 aa29.66■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 TLL2Q9Y6L7 1015 aa29.66■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 MAP3K11Q16584 847 aa29.65■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 SAPCD2Q86UD0 394 aa29.65■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 KLRG1Q96E93 195 aa29.65■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 EHD4Q9H223 541 aa29.65■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 DNAJC18Q9H819 358 aa29.65■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 SERPINB13Q9UIV8 391 aa29.65■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 TBC1D12O60347 775 aa29.64■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 MAP3K10Q02779 954 aa29.64■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 SBK1Q52WX2 424 aa29.64■■■□□ 2.34
RBBP6-211ENST00000568316 FGAP02671 866 aa29.63■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 ALX1Q15699 326 aa29.63■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 STK11IPQ8N1F8 1099 aa29.63■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP29.63■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 DYNLL2Q96FJ2 89 aa29.63■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 DSCC1Q9BVC3 393 aa29.63■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 INPP5BP32019 993 aa29.62■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 LDLRAD1Q5T700 205 aa29.62■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 SLC44A5Q8NCS7 719 aa29.62■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 CLMNQ96JQ2 1002 aa29.62■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 LAMB1P07942 1786 aa29.62■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 OTOFQ9HC10 1997 aa29.61■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 PHF20L1A8MW92 1017 aa29.61■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 MAP3K9P80192 1104 aa29.61■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 PTH1RQ03431 593 aa29.61■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 GABPAQ06546 454 aa29.61■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF112Q9UJU3 913 aa29.61■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa29.6■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa29.6■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 PPARAQ07869 468 aa29.59■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 VGLL4Q14135 290 aa29.59■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 CSADQ9Y600 493 aa29.59■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 ZMYM6O95789 1325 aa29.59■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 SHMT1P34896 483 aa29.58■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 ANO2Q9NQ90 1003 aa29.58■■■□□ 2.33
RBBP6-211ENST00000568316 ROBO3Q96MS0 1386 aa29.57■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 HAND2P61296 217 aa29.57■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 C16orf86Q6ZW13 317 aa29.57■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 ELP3Q9H9T3 547 aa29.57■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 SWAP70Q9UH65 585 aa29.57■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 CDK8P49336 464 aa29.56■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 CTDSPL2Q05D32 466 aa29.56■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 RGMBQ6NW40 437 aa29.56■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa29.56■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 RASSF10A6NK89 507 aa29.55■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 GDF11O95390 407 aa29.55■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 DEFB115Q30KQ5 88 aa29.55■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 TATDN1Q6P1N9 297 aa29.55■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 SLC10A4Q96EP9 437 aa29.55■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 GRM1Q13255 1194 aa29.54■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 SCYL3Q8IZE3 742 aa29.54■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 HHIPL1Q96JK4 782 aa29.54■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 CTNNA3Q9UI47 895 aa29.54■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 UNCXA6NJT0 531 aa29.53■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 CAP2P40123 477 aa29.53■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 CYP4F22Q6NT55 531 aa29.53■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 ANAPC4Q9UJX5 808 aa29.53■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 PRDM1O75626 825 aa29.52■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 JAG1P78504 1218 aa29.52■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa29.52■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 MAP4K1Q92918 833 aa29.52■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 MKNK2Q9HBH9 465 aa29.52■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 PICK1Q9NRD5 415 aa29.52■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 TAOK2Q9UL54 1235 aa29.52■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
RBBP6-211ENST00000568316 DOCK1Q14185 1865 aa29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms