RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNAJA2O60884 412 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAPGEF3O95398 923 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AVPP01185 164 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EPHA1P21709 976 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SOX5P35711 763 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBX4P57082 545 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CABP4P57796 275 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GORABQ5T7V8 394 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC9A7Q96T83 725 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KLHL3Q9UH77 587 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PHF24Q9UPV7 400 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ECEL1O95672 775 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDC27P30260 824 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC7A5Q01650 507 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GNPTABQ3T906 1256 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HDXQ7Z353 690 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EXOC2Q96KP1 924 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDC6Q99741 560 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MCM8Q9UJA3 840 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NAGPAQ9UK23 515 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRC1O43663 620 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SV2CQ496J9 727 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM209AQ5JX71 171 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF180Q86T96 592 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATL2Q8NHH9 583 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EPN3Q9H201 632 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ALG1L2C9J202 215 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 H3BRJ5 948 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPR25O00155 361 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AGRPO00253 132 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TNFRSF10CO14798 259 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SIN3BO75182 1162 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RFPL3O75679 317 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ALDH1L1O75891 902 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDE4BQ07343 736 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MORC4Q8TE76 937 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIF2CQ99661 725 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CORO1BQ9BR76 489 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CSADQ9Y600 493 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLD2O14939 933 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AXIN1O15169 862 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PGRP06401 933 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAG1P15918 1043 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADH7P40394 386 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCNFP41002 786 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDE3AQ14432 1141 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POU4F3Q15319 338 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PMM1Q92871 262 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GMCL1Q96IK5 515 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C8orf48Q96LL4 319 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A1W2PQU0 124 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C2CD2LO14523 706 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYP11A1P05108 521 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms