RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 GTF2IP78347 998 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 NID2Q14112 1375 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 ORC4O43929 436 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 BTDP43251 543 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 ALG1Q9BT22 464 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 COA1Q9GZY4 146 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 CFAP45Q9UL16 551 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 RTN1Q16799 776 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 DOK7Q18PE1 504 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.931e-22■■□□□ 11.6
ACTB-201ENST00000331789 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 FBXW7Q969H0 707 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 SLC26A6Q9BXS9 759 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 RBSNQ9H1K0 784 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 C12orf60Q5U649 245 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 FANCBQ8NB91 859 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 PGBD1Q96JS3 809 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 USP28Q96RU2 1077 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 SLX4Q8IY92 1834 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 H0YIN7 160 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 IFNAR1P17181 557 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.83■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 KIF28PB7ZC32 967 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 NMT2O60551 498 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 LIG1P18858 919 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 CHRNA5P30532 468 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 PDE4BQ07343 736 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 IQCA1Q86XH1 822 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 DYNLL2Q96FJ2 89 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 KRT40Q6A162 431 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 STYK1Q6J9G0 422 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 RCAN1P53805 252 aa20.81■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 NBPF11Q86T75 865 aa20.81■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.81■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 MXD3Q9BW11 206 aa20.81■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 STK36Q9NRP7 1315 aa20.81■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 GUCY1A2P33402 732 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 ATL3Q6DD88 541 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 SLF2Q8IX21 1173 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 TEX11Q8IYF3 940 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 CERS5Q8N5B7 392 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 MYH6P13533 1939 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 F8W031 263 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 RHBDL3P58872 404 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 RGS22Q8NE09 1264 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 GAKO14976 1311 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 PLCD1P51178 756 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 TSPY26PQ9H489 355 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 MYH1P12882 1939 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 TSPY2A6NKD2 308 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 G3V3G9 751 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 BRAPQ7Z569 592 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 CERS3Q8IU89 383 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 EYA3Q99504 573 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 PLCG2P16885 1265 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 TFAP4Q01664 338 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128 ms