RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318074.9

SYTL1-201, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYTL1, Length 1,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-201ENST00000318074 ESR2Q92731 530 aa22.82■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.82■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 TTC14Q96N46 770 aa22.82■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.82■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 KDM4AO75164 1064 aa22.81■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 PRDM1O75626 825 aa22.81■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 FGRP09769 529 aa22.81■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 CHST3Q7LGC8 479 aa22.81■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.81■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.81■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.81■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.81■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.81■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 TNNI2P48788 182 aa22.8■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 TNFAIP1Q13829 316 aa22.8■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 FAM151AQ8WW52 585 aa22.8■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 LAMA4Q16363 1823 aa22.8■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.8■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 PRC1O43663 620 aa22.8■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 AK2P54819 239 aa22.8■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 ANKRD1Q15327 319 aa22.8■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 FAM83AQ86UY5 434 aa22.8■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.8■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.8■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 ORC4O43929 436 aa22.79■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.79■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 HACL1Q9UJ83 578 aa22.79■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.79■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 Q6ZUG5 572 aa22.78■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.78■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 FOCADQ5VW36 1801 aa22.78■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.78■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 NT5C2P49902 561 aa22.78■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.78■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.78■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.78■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 CSRNP1Q96S65 589 aa22.78■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.78■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 EHD4Q9H223 541 aa22.78■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.78■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.77■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 CDK8P49336 464 aa22.77■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 CNTNAP1P78357 1384 aa22.77■■□□□ 1.24
SYTL1-201ENST00000318074 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 SWAP70Q9UH65 585 aa22.76■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.76■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 TSPY2A6NKD2 308 aa22.76■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 ANTXR2P58335 489 aa22.76■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 GABPAQ06546 454 aa22.76■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 RASA3Q14644 834 aa22.76■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.76■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 TMEM87BQ96K49 555 aa22.76■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.76■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.76■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.76■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 IQCA1Q86XH1 822 aa22.75■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 BRF1Q92994 677 aa22.75■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.75■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 LAMB1P07942 1786 aa22.75■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 MYH1P12882 1939 aa22.75■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 ERICH2A1L162 156 aa22.74■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 FBXL16Q8N461 479 aa22.74■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 GGA3Q9NZ52 723 aa22.74■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 TFAP4Q01664 338 aa22.74■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.74■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.74■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.74■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 TSPY3P0CV98 308 aa22.73■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 TSPY8P0CW00 308 aa22.73■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 RASA1P20936 1047 aa22.73■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 EPHX2P34913 555 aa22.73■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 SLC4A3P48751 1232 aa22.73■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.73■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 MTA3Q9BTC8 594 aa22.73■■□□□ 1.23
SYTL1-201ENST00000318074 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms