RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468600.1

SSB-208, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 2

Gene SSB, Length 290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-208ENST00000468600 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa-2.84□□□□□ -2.86
SSB-208ENST00000468600 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP-2.84□□□□□ -2.86
SSB-208ENST00000468600 LINC00846Q9NV44 126 aa-2.84□□□□□ -2.86
SSB-208ENST00000468600 SYNMO15061 1565 aa-2.84□□□□□ -2.86
SSB-208ENST00000468600 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa-2.85□□□□□ -2.86
SSB-208ENST00000468600 TET3O43151 1660 aa-2.85□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 TMEM35BQ8NCS4 154 aa-2.85□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 CDC26Q8NHZ8 85 aa-2.85□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-2.85□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 MAPKBP1O60336 1514 aa-2.85□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 ABCC5O15440 1437 aa-2.85□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 H3BQF6 201 aa-2.86□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-2.86□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 TMEM128Q5BJH2 165 aa-2.86□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 SERP2Q8N6R1 65 aa-2.86□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-2.86□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 LINC01546A6NGU7 62 aa-2.87□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 K7EP13 123 aa-2.87□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 SMPXQ9UHP9 88 aa-2.87□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 SCN11AQ9UI33 1791 aa-2.88□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 CENPEQ02224 2701 aa-2.89□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 H0Y9P7 68 aa-2.89□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 DEFB107AQ8IZN7 70 aa-2.89□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-2.89□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 AP4S1Q9Y587 144 aa-2.89□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 ATP7BP35670 1465 aa-2.9□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa-2.9□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa-2.9□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 TRAPPC2P0DI81 140 aa-2.9□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-2.9□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-2.9□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 PSMG4Q5JS54 123 aa-2.9□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 ARL11Q969Q4 196 aa-2.9□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 MYOM1P52179 1685 aa-2.9□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 ADGRL2O95490 1459 aa-2.9□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 SYNJ1O43426 1573 aa-2.91□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-2.91□□□□□ -2.87
SSB-208ENST00000468600 DEFB130BP0DP73 79 aa-2.91□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 DEFB130AP0DP74 79 aa-2.91□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 COX7BP24311 80 aa-2.91□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 SFTA2Q6UW10 78 aa-2.91□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 KCNRGQ8N5I3 272 aa-2.91□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 ATPIF1Q9UII2 106 aa-2.91□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 TNFSF15O95150 251 aa-2.92□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 SMIM21Q3B7S5 101 aa-2.92□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 GID8Q9NWU2 228 aa-2.92□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 HIGD1AQ9Y241 93 aa-2.92□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 CUX1P39880 1505 aa-2.93□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-2.93□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 SCTP09683 121 aa-2.93□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 C12orf73Q69YU5 71 aa-2.93□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 VAMP8Q9BV40 100 aa-2.93□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 IFI6P09912 130 aa-2.94□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 Q56UQ5 140 aa-2.94□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 TRIQKQ629K1 86 aa-2.94□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 TOMM20LQ6UXN7 152 aa-2.94□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-2.94□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 PLXNC1O60486 1568 aa-2.95□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 C7orf77A4D0Y5 90 aa-2.95□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 IAPPP10997 89 aa-2.95□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP-2.95□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 SAMD13Q5VXD3 122 aa-2.95□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 TRGV9Q99603 122 aa-2.95□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 C12orf57Q99622 126 aa-2.95□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-2.95□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 PREX1Q8TCU6 1659 aa-2.95□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-2.96□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 RGPD5Q99666 1765 aa-2.96□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 COX6CP09669 75 aa-2.96□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 HSD52Q0P140 79 aa-2.96□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 CHMP6Q96FZ7 201 aa-2.96□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 MANBALQ9NQG1 85 aa-2.96□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 NUP188Q5SRE5 1749 aa-2.96□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 UBR3Q6ZT12 1888 aa-2.96□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 ROCK1Q13464 1354 aa-2.97□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 DMDP11532 3685 aa-2.97□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa-2.97□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 J3QR89 54 aa-2.97□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 IGLC6P0CF74 106 aa-2.97□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-2.97□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 SPANXDQ9BXN6 97 aa-2.97□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 PCBD2Q9H0N5 130 aa-2.97□□□□□ -2.88
SSB-208ENST00000468600 KIF20BQ96Q89 1820 aa-2.98□□□□□ -2.89
SSB-208ENST00000468600 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-2.98□□□□□ -2.89
SSB-208ENST00000468600 TCEAL4Q96EI5 215 aa-2.98□□□□□ -2.89
SSB-208ENST00000468600 A2ML1A8K2U0 1454 aa-2.98□□□□□ -2.89
SSB-208ENST00000468600 GRIN2AQ12879 1464 aa-2.98□□□□□ -2.89
SSB-208ENST00000468600 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-2.98□□□□□ -2.89
SSB-208ENST00000468600 TCHHQ07283 1943 aa-2.99□□□□□ -2.89
SSB-208ENST00000468600 CFAP54Q96N23 3096 aa-2.99□□□□□ -2.89
SSB-208ENST00000468600 MT-ATP8P03928 68 aa-2.99□□□□□ -2.89
SSB-208ENST00000468600 SPART-AS1P0CW21 52 aa-2.99□□□□□ -2.89
SSB-208ENST00000468600 S100PP25815 95 aa-2.99□□□□□ -2.89
SSB-208ENST00000468600 PPP3R2Q96LZ3 170 aa-2.99□□□□□ -2.89
SSB-208ENST00000468600 LINC00474Q9P2X8 69 aa-2.99□□□□□ -2.89
SSB-208ENST00000468600 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa-2.99□□□□□ -2.89
SSB-208ENST00000468600 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-3□□□□□ -2.89
SSB-208ENST00000468600 A8MTW9 85 aa-3□□□□□ -2.89
SSB-208ENST00000468600 F8WEM9 126 aa-3□□□□□ -2.89
SSB-208ENST00000468600 SPEF2Q9C093 1822 aa-3□□□□□ -2.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.1 ms