RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436759.6

PLEC-208, Transcript of plectin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEC, Length 14,787 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEC-208ENST00000436759 A0A096LNJ9 63 aa8.47□□□□□ -1.05
PLEC-208ENST00000436759 Q6ZSN1 163 aa8.47□□□□□ -1.05
PLEC-208ENST00000436759 WISP2O76076 250 aa8.46□□□□□ -1.06
PLEC-208ENST00000436759 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PLEC-208ENST00000436759 Q6ZQT0 140 aa8.45□□□□□ -1.06
PLEC-208ENST00000436759 ZNF580Q9UK33 172 aa8.45□□□□□ -1.06
PLEC-208ENST00000436759 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.44□□□□□ -1.06
PLEC-208ENST00000436759 BRI3O95415 125 aa8.44□□□□□ -1.06
PLEC-208ENST00000436759 LRP4O75096 1905 aa8.44□□□□□ -1.06
PLEC-208ENST00000436759 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PLEC-208ENST00000436759 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PLEC-208ENST00000436759 C22orf24Q9Y442 160 aa8.43□□□□□ -1.06
PLEC-208ENST00000436759 INAFM1C9JVW0 142 aa8.43□□□□□ -1.06
PLEC-208ENST00000436759 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.43□□□□□ -1.06
PLEC-208ENST00000436759 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.43□□□□□ -1.06
PLEC-208ENST00000436759 CD164Q04900 197 aa8.42□□□□□ -1.06
PLEC-208ENST00000436759 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.42□□□□□ -1.06
PLEC-208ENST00000436759 THSD7BQ9C0I4 1608 aa8.42□□□□□ -1.06
PLEC-208ENST00000436759 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.41□□□□□ -1.06
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PLEC-208ENST00000436759 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.4□□□□□ -1.06
PLEC-208ENST00000436759 CRIPTQ9P021 101 aa8.39□□□□□ -1.07
PLEC-208ENST00000436759 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.39□□□□□ -1.07
PLEC-208ENST00000436759 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PLEC-208ENST00000436759 LINC00313P59037 77 aa8.39□□□□□ -1.07
PLEC-208ENST00000436759 COL4A3Q01955 1670 aa8.39□□□□□ -1.07
PLEC-208ENST00000436759 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.38□□□□□ -1.07
PLEC-208ENST00000436759 FSHBP01225 129 aa8.38□□□□□ -1.07
PLEC-208ENST00000436759 Q8NBF4 154 aa8.38□□□□□ -1.07
PLEC-208ENST00000436759 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa8.38□□□□□ -1.07
PLEC-208ENST00000436759 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PLEC-208ENST00000436759 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa8.38□□□□□ -1.07
PLEC-208ENST00000436759 IGLV1-51P01701 117 aa8.37□□□□□ -1.07
PLEC-208ENST00000436759 C19orf84I3L1E1 186 aa8.37□□□□□ -1.07
PLEC-208ENST00000436759 Q6ZRU5 148 aa8.37□□□□□ -1.07
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PLEC-208ENST00000436759 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.36□□□□□ -1.07
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PLEC-208ENST00000436759 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PLEC-208ENST00000436759 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.35□□□□□ -1.07
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PLEC-208ENST00000436759 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.34□□□□□ -1.07
PLEC-208ENST00000436759 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.08
PLEC-208ENST00000436759 MDFIQ99750 246 aa8.34□□□□□ -1.08
PLEC-208ENST00000436759 Q6ZRX8 168 aa8.33□□□□□ -1.08
PLEC-208ENST00000436759 A8MWP4 228 aa8.32□□□□□ -1.08
PLEC-208ENST00000436759 C16orf95Q9H693 158 aa8.32□□□□□ -1.08
PLEC-208ENST00000436759 A8MUN3 132 aa8.32□□□□□ -1.08
PLEC-208ENST00000436759 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.32□□□□□ -1.08
PLEC-208ENST00000436759 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.32□□□□□ -1.08
PLEC-208ENST00000436759 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.31□□□□□ -1.08
PLEC-208ENST00000436759 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.31□□□□□ -1.08
PLEC-208ENST00000436759 LINC01600Q96MT4 127 aa8.3□□□□□ -1.08
PLEC-208ENST00000436759 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.29□□□□□ -1.08
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PLEC-208ENST00000436759 FAM229AH3BQW9 127 aa8.28□□□□□ -1.08
PLEC-208ENST00000436759 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.28□□□□□ -1.08
PLEC-208ENST00000436759 LINC00167Q96N53 147 aa8.27□□□□□ -1.09
PLEC-208ENST00000436759 CENPEQ02224 2701 aa8.27□□□□□ -1.09
PLEC-208ENST00000436759 EDN2P20800 178 aa8.27□□□□□ -1.09
PLEC-208ENST00000436759 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PLEC-208ENST00000436759 CENPFP49454 3210 aa8.25□□□□□ -1.09
PLEC-208ENST00000436759 STAB1Q9NY15 2570 aa8.25□□□□□ -1.09
PLEC-208ENST00000436759 LUZP6Q538Z0 58 aa8.24□□□□□ -1.09
PLEC-208ENST00000436759 EPM2AB3EWF7 344 aa8.24□□□□□ -1.09
PLEC-208ENST00000436759 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.24□□□□□ -1.09
PLEC-208ENST00000436759 APLNQ9ULZ1 77 aa8.23□□□□□ -1.09
PLEC-208ENST00000436759 PRR15Q8IV56 129 aa8.23□□□□□ -1.09
PLEC-208ENST00000436759 KLKP1Q107X0 134 aa8.23□□□□□ -1.09
PLEC-208ENST00000436759 IGLV6-57P01721 117 aa8.22□□□□□ -1.09
PLEC-208ENST00000436759 AVPP01185 164 aa8.22□□□□□ -1.09
PLEC-208ENST00000436759 C16orf90A8MZG2 172 aa8.21□□□□□ -1.09
PLEC-208ENST00000436759 LINC00315P59091 139 aa8.21□□□□□ -1.09
PLEC-208ENST00000436759 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.21□□□□□ -1.09
PLEC-208ENST00000436759 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
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PLEC-208ENST00000436759 H3BNG1 76 aa8.2□□□□□ -1.1
PLEC-208ENST00000436759 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.2□□□□□ -1.1
PLEC-208ENST00000436759 FHL3Q13643 280 aa8.19□□□□□ -1.1
PLEC-208ENST00000436759 Q96NJ1 140 aa8.19□□□□□ -1.1
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PLEC-208ENST00000436759 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.17□□□□□ -1.1
PLEC-208ENST00000436759 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.17□□□□□ -1.1
PLEC-208ENST00000436759 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PLEC-208ENST00000436759 Q6ZRP5 223 aa8.17□□□□□ -1.1
PLEC-208ENST00000436759 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.16□□□□□ -1.1
PLEC-208ENST00000436759 H7BZZ5 65 aa8.15□□□□□ -1.1
PLEC-208ENST00000436759 LITAFQ99732 161 aa8.14□□□□□ -1.11
PLEC-208ENST00000436759 K7EQZ3 153 aa8.14□□□□□ -1.11
PLEC-208ENST00000436759 NOTCH1P46531 2555 aa8.11□□□□□ -1.11
PLEC-208ENST00000436759 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.11□□□□□ -1.11
PLEC-208ENST00000436759 CHD6Q8TD26 2715 aa8.11□□□□□ -1.11
PLEC-208ENST00000436759 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PLEC-208ENST00000436759 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PLEC-208ENST00000436759 LINC01554Q52M75 96 aa8.1□□□□□ -1.11
PLEC-208ENST00000436759 WIPF1O43516 503 aa8.1□□□□□ -1.11
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