RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592326.1

USP36-223, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 5

Gene USP36, Length 406 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-223	ENST00000592326	VCY	O14598	125 aa		7.41	□□□□□ -1.22
USP36-223	ENST00000592326	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		7.41	□□□□□ -1.22
USP36-223	ENST00000592326	NIT1	Q86X76	327 aa		7.41	□□□□□ -1.22
USP36-223	ENST00000592326	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		7.41	□□□□□ -1.22
USP36-223	ENST00000592326	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		7.41	□□□□□ -1.22
USP36-223	ENST00000592326	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		7.41	□□□□□ -1.22
USP36-223	ENST00000592326	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
USP36-223	ENST00000592326		I3L3M4	83 aa		7.4	□□□□□ -1.22
USP36-223	ENST00000592326	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		7.4	□□□□□ -1.22
USP36-223	ENST00000592326	TCAP	O15273	167 aa		7.39	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	CRP	P02741	224 aa		7.39	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	PMCH	P20382	165 aa		7.39	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326		Q0VG73	95 aa		7.39	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326		Q8N8P6	123 aa		7.39	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		7.39	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	KIR2DL4	Q99706	377 aa		7.39	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326		K7EMI3	77 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	OXT	P01178	125 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	COTL1	Q14019	142 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	C14orf177	Q52M58	125 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	LINC01546	A6NGU7	62 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	TSHB	P01222	138 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	HIST1H2BK	O60814	126 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	HIST1H2BO	P23527	126 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	HIST1H2BB	P33778	126 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	HIST1H2BD	P58876	126 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	HIST1H2BC	P62807	126 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	ESD	P10768	282 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	FCER1G	P30273	86 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	AMT	P48728	403 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	RAB5B	P61020	215 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326		H7C423	109 aa		7.34	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	LINC00614	P0C842	121 aa		7.34	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	FA2H	Q7L5A8	372 aa		7.34	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		7.34	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		7.34	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	TMEM243	Q9BU79	118 aa		7.34	□□□□□ -1.23
USP36-223	ENST00000592326	USP17L23	D6RBM5	183 aa		7.33	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	PKIA	P61925	76 aa		7.33	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	ENHO	Q6UWT2	76 aa		7.33	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	BAGE3	Q86Y29	109 aa		7.33	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		7.33	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		7.32	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	MYCBP2	O75592	4640 aa		7.32	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	G0S2	P27469	103 aa		7.32	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	MPV17L2	Q567V2	206 aa		7.32	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		7.32	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	TMEM18	Q96B42	140 aa		7.32	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	DPH3	Q96FX2	82 aa		7.32	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	LINC01549	A6NIU2	74 aa		7.31	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	UBE2L6	O14933	153 aa		7.31	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	LINC00310	P59036	64 aa		7.31	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	MIA	Q16674	131 aa		7.31	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326		A0A1B0GUV1	79 aa		7.3	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	SERF1A	O75920	110 aa		7.3	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	PRSS1	P07477	247 aa		7.3	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		7.3	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	GAGE6	Q13070	117 aa		7.3	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		7.3	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		7.3	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		7.3	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		7.3	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326		A0A096LNJ9	63 aa		7.29	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	HSBP1	O75506	76 aa		7.29	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	FGF6	P10767	208 aa		7.29	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		7.29	□□□□□ -1.24
USP36-223	ENST00000592326	TOMM6	Q96B49	74 aa		7.29	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms