RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBE2BP63146 152 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TPRXLQ17RH7 258 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TEX261Q6UWH6 196 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRAP2Q96G30 205 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM210AQ96ND0 272 aa9.75□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM168BA1KXE4 195 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 G3V3Q6 166 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFNA1P01562 189 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PMCHP20382 165 aa9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 F8WDY8 70 aa9.73□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TWIST1Q15672 202 aa9.73□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C9orf62Q8N4C0 152 aa9.73□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPAG11BQ08648 103 aa9.72□□□□□ -0.85
RFX3-AS1-201ENST00000423112 M0QXV9 152 aa9.71□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF861PO60384 105 aa9.71□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.71□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CTRLP40313 264 aa9.71□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.71□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.71□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNFNQ9BYD5 112 aa9.71□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFITM3Q01628 133 aa9.7□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.7□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SFT2D1Q8WV19 159 aa9.7□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MUC17Q685J3 4493 aa9.7□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CRYGAP11844 174 aa9.69□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEFA1P59665 94 aa9.69□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.69□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CENPWQ5EE01 88 aa9.69□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C5orf38Q86SI9 138 aa9.69□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMIM12Q96EX1 92 aa9.69□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDUFA13Q9P0J0 144 aa9.69□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.68□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDUFA1O15239 70 aa9.68□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSHBP01222 138 aa9.68□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.68□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.68□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALG5Q9Y673 324 aa9.68□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A087X002 238 aa9.67□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.67□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q5BKY6 102 aa9.67□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.67□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BIN3Q9NQY0 253 aa9.67□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.66□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.66□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C7orf77A4D0Y5 90 aa9.66□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GAGE2EQ4V326 116 aa9.66□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C11orf52Q96A22 123 aa9.66□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.66□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.66□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.66□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.65□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1B0GV50 99 aa9.65□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GNG4P50150 75 aa9.65□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.65□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ST20Q9HBF5 79 aa9.65□□□□□ -0.86
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUPR1O60356 82 aa9.64□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM213BQ8TBF2 198 aa9.64□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.64□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UMAD1C9J7I0 102 aa9.63□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GIPP09681 153 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCL20P78556 96 aa9.63□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C10orf25Q5T742 122 aa9.62□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.62□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYTL1Q9NRR1 136 aa9.62□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.61□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.61□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MANBALQ9NQG1 85 aa9.61□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.61□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB19A4D1S5 217 aa9.6□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.6□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CTAG1AP78358 180 aa9.6□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.6□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUDT11Q96G61 164 aa9.6□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.6□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.59□□□□□ -0.87
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FCER1GP30273 86 aa9.58□□□□□ -0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.58□□□□□ -0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.57□□□□□ -0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GNG13Q9P2W3 67 aa9.57□□□□□ -0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.56□□□□□ -0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.55□□□□□ -0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.55□□□□□ -0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.55□□□□□ -0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VCYO14598 125 aa9.55□□□□□ -0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q6ZUT4 128 aa9.55□□□□□ -0.88
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