RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516524.1

RNU6-964P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 964, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-964P, Length 69 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-964P-201ENST00000516524 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RNU6-964P-201ENST00000516524 ZNF69Q9UC07 566 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-964P-201ENST00000516524 ZNF180Q9UJW8 692 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-964P-201ENST00000516524 KIF4AO95239 1232 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 EYA4O95677 639 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 CLCQ05315 142 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 DHCR24Q15392 516 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 RUNDC1Q96C34 613 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 CEP63Q96MT8 703 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 MTA3Q9BTC8 594 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 DHRS4Q9BTZ2 278 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 STRN4Q9NRL3 753 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 SALL4Q9UJQ4 1053 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 INTUQ9ULD6 942 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 ADCY3O60266 1144 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 TRIM27P14373 513 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 CCNFP41002 786 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 VHLLQ6RSH7 139 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 TEX19Q8NA77 164 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 OR13H1Q8NG92 308 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 HOOK2Q96ED9 719 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 ZHX3Q9H4I2 956 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 CHST12Q9NRB3 414 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 ATG3Q9NT62 314 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 B2RBV5 119 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 GGCXP38435 758 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 TRAPPC10P48553 1259 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 MTMR1Q13613 665 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 C4orf17Q53FE4 359 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 CNNM4Q6P4Q7 775 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 Q6ZVU0 165 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 PLD4Q96BZ4 506 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 FBRSQ9HAH7 460 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP25Q9UHP3 1055 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 GPR39O43194 453 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 SUSD5O60279 629 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 APPP05067 770 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 PHKG2P15735 406 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 HTR3AP46098 478 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 DGKGP49619 791 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 EMP3P54852 163 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 RGL3Q3MIN7 710 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 NCAPG2Q86XI2 1143 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 MYRIPQ8NFW9 859 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 OSMRQ99650 979 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 LZTS1Q9Y250 596 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 F2P00734 622 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 MYL3P08590 195 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 FLT3P36888 993 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 CASP2P42575 452 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 SLC10A6Q3KNW5 377 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 WDR44Q5JSH3 913 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 SPICE1Q8N0Z3 855 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 PAGR1Q9BTK6 254 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 KANSL3Q9P2N6 904 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 TRAV20A0A0B4J274 112 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 ANO9A1A5B4 782 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 RAPGEF3O95398 923 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-964P-201ENST00000516524 NR3C2P08235 984 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms