RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489537.5

SF3A3-208, Transcript of splicing factor 3a subunit 3, human

TSL 4

Gene SF3A3, Length 891 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SF3A3-208	ENST00000489537	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537		A0A0D9SFI3	127 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	NR1I2	O75469	434 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	MBD3	O95983	291 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	DPEP1	P16444	411 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	FGFR2	P21802	821 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	C1QTNF8	P60827	252 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	ST5	P78524	1137 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	FGD1	P98174	961 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	WASHC4	Q2M389	1173 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	VPS37D	Q86XT2	251 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	TTC14	Q96N46	770 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		7.52	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	NUP98	P52948	1817 aa		7.52	□□□□□ -1.2
SF3A3-208	ENST00000489537	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	RPS6KB1	P23443	525 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	PRELP	P51888	382 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	PTH1R	Q03431	593 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	ALX1	Q15699	326 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	CCDC102B	Q68D86	513 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	SPATA5	Q8NB90	893 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	AIDA	Q96BJ3	306 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	FAM227B	Q96M60	508 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	MYH3	P11055	1940 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	TM4SF1	P30408	202 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	CHRNA5	P30532	468 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	AK2	P54819	239 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	CHRND	Q07001	517 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	CNBD1	Q8NA66	436 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	PALD1	Q9ULE6	856 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	ZNF213	O14771	459 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	BBOX1	O75936	387 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	BRD1	O95696	1058 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	MCM5	P33992	734 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	ADD2	P35612	726 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	ZAP70	P43403	619 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	PPP2R5B	Q15173	497 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	ATL3	Q6DD88	541 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	TMTC2	Q8N394	836 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	NCOA7	Q8NI08	942 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	KRT23	Q9C075	422 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	LAMB2	P55268	1798 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	SCN7A	Q01118	1682 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	MAST3	O60307	1309 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	TRAK2	O60296	914 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	GRIN3B	O60391	1043 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	CDKL5	O76039	1030 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	LDHC	P07864	332 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	MCAM	P43121	646 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	RCAN1	P53805	252 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	GSTO1	P78417	241 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	NFIX	Q14938	502 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	ERFE	Q4G0M1	354 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SF3A3-208	ENST00000489537	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		7.49	□□□□□ -1.21

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