RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa31.62■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 YDJCA8MPS7 323 aa31.62■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 SCNN1DP51172 638 aa31.62■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 NECAB1Q8N987 351 aa31.62■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 PCP11498 1178 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
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HOXB3-210ENST00000489475 STK11IPQ8N1F8 1099 aa31.61■■■□□ 2.65
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HOXB3-210ENST00000489475 TACC3Q9Y6A5 838 aa31.61■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
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HOXB3-210ENST00000489475 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 KIAA0825Q8IV33 1275 aa31.61■■■□□ 2.65
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HOXB3-210ENST00000489475 TMEM87BQ96K49 555 aa31.59■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 ZSWIM5Q9P217 1185 aa31.59■■■□□ 2.65
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HOXB3-210ENST00000489475 USP17L8P0C7I0 530 aa31.58■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 CRKP46108 304 aa31.58■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 NUCB2P80303 420 aa31.58■■■□□ 2.65
HOXB3-210ENST00000489475 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa31.58■■■□□ 2.65
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HOXB3-210ENST00000489475 ESR2Q92731 530 aa31.57■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
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HOXB3-210ENST00000489475 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 SMIM22K7EJ46 135 aa31.56■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 EVCP57679 992 aa31.56■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 NLGN2Q8NFZ4 835 aa31.56■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 GTF3C6Q969F1 213 aa31.56■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 ZNRF3Q9ULT6 936 aa31.56■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
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HOXB3-210ENST00000489475 C12orf60Q5U649 245 aa31.56■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 ZDHHC15Q96MV8 337 aa31.56■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa31.55■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 PFKFB2O60825 505 aa31.55■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 RAB3GAP1Q15042 981 aa31.55■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 MYO3BQ8WXR4 1341 aa31.55■■■□□ 2.64
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HOXB3-210ENST00000489475 RAD17O75943 681 aa31.54■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 SART3Q15020 963 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
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HOXB3-210ENST00000489475 SERPINA10Q9UK55 444 aa31.54■■■□□ 2.64
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HOXB3-210ENST00000489475 TMEM67Q5HYA8 995 aa31.54■■■□□ 2.64
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HOXB3-210ENST00000489475 COL4A5P29400 1685 aa31.54■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 PSME4Q14997 1843 aa31.53■■■□□ 2.64
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HOXB3-210ENST00000489475 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
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HOXB3-210ENST00000489475 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 ILDR2Q71H61 639 aa31.53■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa31.53■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 CHMP4CQ96CF2 233 aa31.53■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 MTA3Q9BTC8 594 aa31.53■■■□□ 2.64
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HOXB3-210ENST00000489475 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa31.52■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 ORC4O43929 436 aa31.52■■■□□ 2.64
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HOXB3-210ENST00000489475 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP31.52■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa31.52■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 JDP2Q8WYK2 163 aa31.52■■■□□ 2.64
HOXB3-210ENST00000489475 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP31.52■■■□□ 2.64
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HOXB3-210ENST00000489475 EVX2Q03828 476 aa31.52■■■□□ 2.64
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HOXB3-210ENST00000489475 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
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HOXB3-210ENST00000489475 UBAC1Q9BSL1 405 aa31.51■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 BRPF3Q9ULD4 1205 aa31.51■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 LTBP3Q9NS15 1303 aa31.5■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 PRDM1O75626 825 aa31.5■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 GJB2P29033 226 aa31.5■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 SCRN1Q12765 414 aa31.5■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 ROBO3Q96MS0 1386 aa31.5■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 LIFRP42702 1097 aa31.49■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 LY9Q9HBG7 655 aa31.49■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa31.49■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 GOLGA8BA8MQT2 603 aa31.49■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 NFXL1Q6ZNB6 911 aa31.49■■■□□ 2.63
HOXB3-210ENST00000489475 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
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