RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPDYE5A6NIY4 337 aa19.04■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ALDH1A1P00352 501 aa19.04■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 INPP5BP32019 993 aa19.04■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DGKZQ13574 1117 aa19.04■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CFHR5Q9BXR6 569 aa19.04■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MCOLN1Q9GZU1 580 aa19.04■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF112Q9UJU3 913 aa19.04■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ABHD8Q96I13 439 aa19.03■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MS4A4AQ96JQ5 239 aa19.03■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa19.03■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa19.03■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPR25O00155 361 aa19.02■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RAB11FIP3O75154 756 aa19.02■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ERO1BQ86YB8 467 aa19.02■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTPN18Q99952 460 aa19.02■□□□□ 0.64
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NPM3O75607 178 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GTF2A2P52657 109 aa19.01■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADGRA1Q86SQ6 560 aa19.01■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BRI3BPQ8WY22 251 aa19.01■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BCL11AQ9H165 835 aa19.01■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP19.01■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa19■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IDH1O75874 414 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLURP2P0DP57 97 aa19■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPIL2Q13356 520 aa19■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCL15Q16663 113 aa19■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa19■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TEX11Q8IYF3 940 aa19■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANTXR1Q9H6X2 564 aa19■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IRF6O14896 467 aa18.99■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGSF3O75054 1194 aa18.99■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BAG3O95817 575 aa18.99■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RRP1P56182 461 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PHF20L1A8MW92 1017 aa18.98■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLCG2P16885 1265 aa18.98■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CYP7A1P22680 504 aa18.98■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPP4CP60510 307 aa18.98■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAP3K10Q02779 954 aa18.98■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPATQ06203 517 aa18.98■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CRHR2Q13324 411 aa18.98■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FKTNO75072 461 aa18.97■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CETPP11597 493 aa18.97■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SNAPC2Q13487 334 aa18.97■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAP3K12Q12852 859 aa18.96■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM43AQ8N2R8 423 aa18.96■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAGEB6Q8N7X4 407 aa18.96■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP18.96■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa18.96■□□□□ 0.63
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM196BA6NMK8 535 aa18.95■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa18.95■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SCYL3Q8IZE3 742 aa18.95■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MIGA1Q8NAN2 632 aa18.95■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa18.95■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LRRCC1Q9C099 1032 aa18.95■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FOCADQ5VW36 1801 aa18.95■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC85CA6NKD9 419 aa18.94■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TBC1D12O60347 775 aa18.94■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP18.94■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PICK1Q9NRD5 415 aa18.94■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCNH4Q9UQ05 1017 aa18.94■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DOCK1Q14185 1865 aa18.94■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FLT1P17948 1338 aa18.94■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BTBD19C9JJ37 291 aa18.93■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GOLIM4O00461 696 aa18.93■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SIPA1L1O43166 1804 aa18.93■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTPRAP18433 802 aa18.92■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BOLA2Q9H3K6 86 aa18.92■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DCTPP1Q9H773 170 aa18.92■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa18.92■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa18.92■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZHX2Q9Y6X8 837 aa18.92■□□□□ 0.62
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATP5JP18859 108 aa18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms