RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 RGMBQ6NW40 437 aa8.51□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.51□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 FOXJ1Q92949 421 aa8.51□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 HYPKQ9NX55 129 aa8.51□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.5□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 RPS12P25398 132 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 NOGQ13253 232 aa8.5□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 DGKZQ13574 1117 aa8.5□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.5□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 MYD88Q99836 296 aa8.5□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 PODXL2Q9NZ53 605 aa8.5□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 LYPD8Q6UX82 237 aa8.49□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.49□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.49□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 GMLQ99445 158 aa8.49□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 EYA3Q99504 573 aa8.49□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa8.49□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 GGA3Q9NZ52 723 aa8.49□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 UFL1O94874 794 aa8.48□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
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HOXD8-202ENST00000429017 C2orf69Q8N8R5 385 aa8.48□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 C8orf58Q8NAV2 365 aa8.48□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 CDCA5Q96FF9 252 aa8.48□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 RNF186Q9NXI6 227 aa8.48□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 PSME4Q14997 1843 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 APAF1O14727 1248 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGEF15O94989 841 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 MTMR2Q13614 643 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
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HOXD8-202ENST00000429017 MOB2Q70IA6 237 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 CSRNP1Q96S65 589 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 GGA1Q9UJY5 639 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF609O15014 1411 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 PDE8AO60658 829 aa8.47□□□□□ -1.05
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HOXD8-202ENST00000429017 CCDC191Q8NCU4 936 aa8.47□□□□□ -1.05
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HOXD8-202ENST00000429017 IFT57Q9NWB7 429 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXD8-202ENST00000429017 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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HOXD8-202ENST00000429017 BMP2P12643 396 aa8.46□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC152Q4G0S7 254 aa8.46□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.46□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa8.46□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 AGBL3Q8NEM8 1001 aa8.46□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 SAGE1Q9NXZ1 904 aa8.46□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.45□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa8.45□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 MYOZ2Q9NPC6 264 aa8.45□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa8.45□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 XDHP47989 1333 aa8.45□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 SPEF2Q9C093 1822 aa8.45□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 USP17L3A6NCW0 530 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 USP17L4A6NCW7 530 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 UBE2Q2LH0YL09 131 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 USP17L8P0C7I0 530 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 ATP2B4P23634 1241 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 CTSWP56202 376 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 SOX10P56693 466 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 GNAI1P63096 354 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 NBPF9Q3BBW0 867 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 TTLL11Q8NHH1 800 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 WHAMMQ8TF30 809 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 GREM2Q9H772 168 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 MAP10Q9P2G4 905 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 MINPP1Q9UNW1 487 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 AKAP11Q9UKA4 1901 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 PI4KAP2A4QPH2 592 aa8.43□□□□□ -1.06
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