RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.17■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ERO1BQ86YB8 467 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 APBB1O00213 710 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 INPP5BP32019 993 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 PICALMQ13492 652 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 MAP3K10Q02779 954 aa25.14■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 OTUD5Q96G74 571 aa25.14■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPN18Q99952 460 aa25.14■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 GTF2A2P52657 109 aa25.13■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP4CP60510 307 aa25.13■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR25O00155 361 aa25.12■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 CAPN15O75808 1086 aa25.12■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 BAG3O95817 575 aa25.12■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.12■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 ABHD8Q96I13 439 aa25.12■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.12■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.12■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 PPIL2Q13356 520 aa25.12■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 DGKZQ13574 1117 aa25.12■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.12■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 TEX11Q8IYF3 940 aa25.12■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.12■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.11■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 IRF6O14896 467 aa25.11■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 PLCG2P16885 1265 aa25.11■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 PPATQ06203 517 aa25.11■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.11■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.11■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.1■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 CCL15Q16663 113 aa25.1■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.09■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 TBC1D12O60347 775 aa25.09■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 CYP7A1P22680 504 aa25.09■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
UBE2E3-201ENST00000392415 CETPP11597 493 aa25.08■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 MAP3K12Q12852 859 aa25.08■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 SNAPC2Q13487 334 aa25.08■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.08■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 FOCADQ5VW36 1801 aa25.08■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 FKTNO75072 461 aa25.07■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 SLURP2P0DP57 97 aa25.07■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.07■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 BCL11AQ9H165 835 aa25.07■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 DCTPP1Q9H773 170 aa25.07■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 CRHR2Q13324 411 aa25.06■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.06■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.05■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.05■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa25.05■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP5JP18859 108 aa25.04■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 CERS3Q8IU89 383 aa25.04■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.04■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 FLT1P17948 1338 aa25.03■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 DOCK1Q14185 1865 aa25.03■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.03■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.03■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 PICK1Q9NRD5 415 aa25.03■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.03■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 BTBD19C9JJ37 291 aa25.02■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 GOLIM4O00461 696 aa25.02■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
UBE2E3-201ENST00000392415 CXCL11O14625 94 aa25.01■■□□□ 1.59
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPRAP18433 802 aa25.01■■□□□ 1.59
UBE2E3-201ENST00000392415 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.01■■□□□ 1.59
UBE2E3-201ENST00000392415 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa25.01■■□□□ 1.59
UBE2E3-201ENST00000392415 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.01■■□□□ 1.59
UBE2E3-201ENST00000392415 SIPA1L1O43166 1804 aa25.01■■□□□ 1.59
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM196BA6NMK8 535 aa25■■□□□ 1.59
UBE2E3-201ENST00000392415 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
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