RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368215.7

PTPRK-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 4,651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-206ENST00000368215 SYT10Q6XYQ8 523 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 INCENPQ9NQS7 918 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 USP17L12C9JPN9 530 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 USP17L21D6R901 530 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 ADD2P35612 726 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 PPARAQ07869 468 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 ATG3Q9NT62 314 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 FBXO3Q9UK99 471 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 KIF5CO60282 957 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 FANCCQ00597 558 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 FAM182BQ5T319 152 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 APOA5Q6Q788 366 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 STOX1Q6ZVD7 989 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 ATG9AQ7Z3C6 839 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF654Q8IZM8 581 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 ZBTB9Q96C00 473 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 RIMBP2O15034 1052 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 UBE3CQ15386 1083 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 NAPAP54920 295 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 TMCO3Q6UWJ1 677 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 TRIM47Q96LD4 638 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 CEP89Q96ST8 783 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 CALM1P0DP23 149 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 CALM2P0DP24 149 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 CALM3P0DP25 149 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 PGBD1Q96JS3 809 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-206ENST00000368215 ZMYM6O95789 1325 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 CUTAO60888 179 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 BMP15O95972 392 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF76P36508 570 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 NLRP12P59046 1061 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 KARSQ15046 597 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF827Q17R98 1081 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 SKIDA1Q1XH10 827 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 CCDC178Q5BJE1 867 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 RPS8P62241 208 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 GSTO1P78417 241 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 SUSD4Q5VX71 490 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 ANKRD2Q9GZV1 360 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 AK9Q5TCS8 1911 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 TNS3Q68CZ2 1445 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 A0A0G2JLW4 131 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 ST5P78524 1137 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 RASGRF1Q13972 1273 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF804AQ7Z570 1209 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 RCOR1Q9UKL0 485 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 TNKSO95271 1327 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 PTPN21Q16825 1174 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 SLF2Q8IX21 1173 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 LCORLQ8N3X6 602 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 ERICH4A6NGS2 130 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 DNA2P51530 1060 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 SERTAD1Q9UHV2 236 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 PXDNLA1KZ92 1463 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 TMEM266Q2M3C6 531 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 CNBD1Q8NA66 436 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 FANCBQ8NB91 859 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 MYRIPQ8NFW9 859 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 CALML4Q96GE6 196 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 UBA5Q9GZZ9 404 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF609O15014 1411 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 PXDNQ92626 1479 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 EIF6P56537 245 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 DPCR1Q3MIW9 517 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 ISCA1Q9BUE6 129 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 UFL1O94874 794 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 GNAQP50148 359 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-206ENST00000368215 LINC00301Q8NCQ3 95 aa9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms