RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.92□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.92□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 CNFNQ9BYD5 112 aa6.92□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 NIT2Q9NQR4 276 aa6.92□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 USP17L23D6RBM5 183 aa6.91□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 GAS8-AS1O95177 125 aa6.91□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.91□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 PRR34Q9NV39 138 aa6.91□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 PRSS1P07477 247 aa6.9□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 REG3AQ06141 175 aa6.9□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 MIAQ16674 131 aa6.9□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 WDR73Q6P4I2 378 aa6.9□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 SCXQ7RTU7 201 aa6.9□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.9□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 TMEM243Q9BU79 118 aa6.9□□□□□ -1.3
NELFE-213ENST00000494956 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 AMTP48728 403 aa6.89□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.89□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 LINC01551Q86U37 167 aa6.89□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 FAM210AQ96ND0 272 aa6.89□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.88□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 ZNF727A8MUV8 499 aa6.88□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 A8MWL6 223 aa6.88□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 C9JQL5 133 aa6.88□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 PKIAP61925 76 aa6.88□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 COTL1Q14019 142 aa6.88□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.88□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 FAT1Q14517 4588 aa6.88□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.87□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 A0A1B0GUV1 79 aa6.86□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 HIGD1CA8MV81 97 aa6.86□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 UBE2L6O14933 153 aa6.86□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 C14orf177Q52M58 125 aa6.86□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.85□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 PANO1I0J062 215 aa6.85□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 CT83Q5H943 113 aa6.85□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.85□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 TSKUQ8WUA8 353 aa6.85□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 RNF185Q96GF1 192 aa6.85□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.85□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 OSTCQ9NRP0 149 aa6.85□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 V9GYV3 84 aa6.85□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 FAM231BA6NCW3 169 aa6.84□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 SMKR1H3BMG3 65 aa6.84□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 SLPIP03973 132 aa6.84□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 AMN1Q8IY45 258 aa6.84□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 ISOC2Q96AB3 205 aa6.84□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.84□□□□□ -1.31
NELFE-213ENST00000494956 A0A1B0GUT8 65 aa6.83□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 hDV102S1A0JD36 115 aa6.83□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.83□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 NCR2O95944 276 aa6.83□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 APCSP02743 223 aa6.83□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 RAB4AP20338 218 aa6.83□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.83□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 NUP35Q8NFH5 326 aa6.83□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 BORCS7Q96B45 105 aa6.83□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.83□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.82□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 TSHBP01222 138 aa6.82□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 FGF6P10767 208 aa6.82□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 PMCHP20382 165 aa6.82□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 ADIRFQ15847 76 aa6.82□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.82□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.82□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.82□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.82□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.81□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 I3L3M4 83 aa6.81□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.81□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.81□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 TEX261Q6UWH6 196 aa6.81□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.81□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 C15orf56Q8N910 161 aa6.81□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 ST20Q9HBF5 79 aa6.81□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 CHTF8P0CG12 524 aa6.8□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 ESDP10768 282 aa6.8□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.8□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.8□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 RIGQ13278 110 aa6.79□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 NRACQ8N912 160 aa6.79□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 NAT8Q9UHE5 227 aa6.79□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.78□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 CAMPP49913 170 aa6.78□□□□□ -1.32
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