RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449159.5

SMPD4-211, Transcript of sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMPD4, Length 635 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4-211ENST00000449159 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.18□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.18□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.17□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 TSHBP01222 138 aa7.17□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 NPYP01303 97 aa7.17□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 AMTP48728 403 aa7.17□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 IQCJQ1A5X6 159 aa7.17□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 MPV17L2Q567V2 206 aa7.17□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.17□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.16□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.16□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 A0A087WX48 190 aa7.16□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.16□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 I3L3M4 83 aa7.16□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 TNFRSF6BO95407 300 aa7.16□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 PMCHP20382 165 aa7.16□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 GAGE6Q13070 117 aa7.16□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 ORMDL3Q8N138 153 aa7.16□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 Q8N976 141 aa7.16□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.15□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 TMEM262E9PQX1 116 aa7.15□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 PPP1R17O96001 155 aa7.15□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 APCSP02743 223 aa7.15□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 PPBPP02775 128 aa7.15□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 ELOBQ15370 118 aa7.15□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.15□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 PRELID3AQ96N28 172 aa7.15□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 TMEM243Q9BU79 118 aa7.15□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 Q9HAA7 133 aa7.15□□□□□ -1.26
SMPD4-211ENST00000449159 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.15□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 A0A1B0GVY2 172 aa7.14□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.14□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 K7EP13 123 aa7.14□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.14□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.14□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 C20orf78Q9BR46 151 aa7.14□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.14□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.14□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 KLK12Q9UKR0 248 aa7.14□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 VCYO14598 125 aa7.13□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 HLA-DQA1P01909 254 aa7.13□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 RBX1P62877 108 aa7.13□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 LAGE3Q14657 143 aa7.13□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 YPEL4Q96NS1 127 aa7.13□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.13□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.12□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.12□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 PHOX2AO14813 284 aa7.12□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 UBE2L6O14933 153 aa7.12□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 ESDP10768 282 aa7.12□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 TNP2Q05952 138 aa7.12□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.12□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.11□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 TCAPO15273 167 aa7.11□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 S100A1P23297 94 aa7.11□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 FCER1GP30273 86 aa7.11□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 PKIAP61925 76 aa7.11□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.11□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 UBE2WQ96B02 151 aa7.11□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 KIR2DL4Q99706 377 aa7.11□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.11□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 MT-ND6P03923 174 aa7.1□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 FGF6P10767 208 aa7.1□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 COX19Q49B96 90 aa7.1□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 ENHOQ6UWT2 76 aa7.1□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 NFE4Q86UQ8 179 aa7.1□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.1□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.1□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.1□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.09□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 A0A1B0GUV1 79 aa7.09□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.09□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.09□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.09□□□□□ -1.27
SMPD4-211ENST00000449159 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.08□□□□□ -1.28
SMPD4-211ENST00000449159 PRSS47A8MTI9 375 aa7.08□□□□□ -1.28
SMPD4-211ENST00000449159 H7C423 109 aa7.08□□□□□ -1.28
SMPD4-211ENST00000449159 SCO1O75880 301 aa7.08□□□□□ -1.28
SMPD4-211ENST00000449159 CRPP02741 224 aa7.08□□□□□ -1.28
SMPD4-211ENST00000449159 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
SMPD4-211ENST00000449159 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SMPD4-211ENST00000449159 REG3AQ06141 175 aa7.08□□□□□ -1.28
SMPD4-211ENST00000449159 Q8N8P6 123 aa7.08□□□□□ -1.28
SMPD4-211ENST00000449159 PRR34Q9NV39 138 aa7.08□□□□□ -1.28
SMPD4-211ENST00000449159 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.07□□□□□ -1.28
SMPD4-211ENST00000449159 PSCAO43653 123 aa7.07□□□□□ -1.28
SMPD4-211ENST00000449159 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.07□□□□□ -1.28
SMPD4-211ENST00000449159 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.06□□□□□ -1.28
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