RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 SMKR1H3BMG3 65 aa13.63□□□□□ -0.23
CLDN3-201ENST00000395145 I3L3M4 83 aa13.63□□□□□ -0.23
CLDN3-201ENST00000395145 AMTP48728 403 aa13.63□□□□□ -0.23
CLDN3-201ENST00000395145 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
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CLDN3-201ENST00000395145 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa13.62□□□□□ -0.23
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CLDN3-201ENST00000395145 PRR34Q9NV39 138 aa13.58□□□□□ -0.24
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CLDN3-201ENST00000395145 SPATA12Q7Z6I5 190 aa13.57□□□□□ -0.24
CLDN3-201ENST00000395145 C20orf203Q8NBC4 194 aa13.57□□□□□ -0.24
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CLDN3-201ENST00000395145 ESDP10768 282 aa13.56□□□□□ -0.24
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP10-2P60368 255 aa13.56□□□□□ -0.24
CLDN3-201ENST00000395145 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa13.55□□□□□ -0.24
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CLDN3-201ENST00000395145 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa13.54□□□□□ -0.24
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CLDN3-201ENST00000395145 LINC00269Q8N2A0 174 aa13.54□□□□□ -0.24
CLDN3-201ENST00000395145 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
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CLDN3-201ENST00000395145 C1orf43Q9BWL3 253 aa13.53□□□□□ -0.24
CLDN3-201ENST00000395145 C16orf90A8MZG2 172 aa13.52□□□□□ -0.25
CLDN3-201ENST00000395145 S100PP25815 95 aa13.52□□□□□ -0.25
CLDN3-201ENST00000395145 REG3AQ06141 175 aa13.52□□□□□ -0.25
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CLDN3-201ENST00000395145 RPS10P5Q9NQ39 176 aa13.51□□□□□ -0.25
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CLDN3-201ENST00000395145 APOC3P02656 99 aa13.5□□□□□ -0.25
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CLDN3-201ENST00000395145 HLA-DQA1P01909 254 aa13.45□□□□□ -0.26
CLDN3-201ENST00000395145 COX19Q49B96 90 aa13.45□□□□□ -0.26
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM101Q96IK0 257 aa13.45□□□□□ -0.26
CLDN3-201ENST00000395145 GNB1LQ9BYB4 327 aa13.45□□□□□ -0.26
CLDN3-201ENST00000395145 LECT2O14960 151 aa13.44□□□□□ -0.26
CLDN3-201ENST00000395145 OR5A1Q8NGJ0 315 aa13.44□□□□□ -0.26
CLDN3-201ENST00000395145 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
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