RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDE6DO43924 150 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 INAFM2P0DMQ5 153 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPS20P60866 119 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC51BQ86UW2 128 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MED9Q9NWA0 146 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBFOX3A6NFN3 312 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGLV2-8P01709 118 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa15.4■□□□□ 0.06
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHCHD5Q9BSY4 110 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM30AQ9NZY2 134 aa15.39■□□□□ 0.05
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 MPV17L2Q567V2 206 aa15.36■□□□□ 0.05
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 Q6ZNX1 250 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAT1Q14517 4588 aa15.34■□□□□ 0.05
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 M0QY20 66 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LINC01620Q4KN68 170 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SUMO4Q6EEV6 95 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LYZL1Q6UWQ5 148 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa15.31■□□□□ 0.04
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 AKAP14Q86UN6 197 aa15.31■□□□□ 0.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUDT10Q8NFP7 164 aa15.31■□□□□ 0.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUDT11Q96G61 164 aa15.31■□□□□ 0.04
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa15.29■□□□□ 0.04
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 RASL11AQ6T310 242 aa15.28■□□□□ 0.04
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 DPH3P1Q9H4G8 78 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MIAQ16674 131 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IQCJQ1A5X6 159 aa15.27■□□□□ 0.04
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR73Q6P4I2 378 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLPSL2Q6UWE3 100 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ALKAL2Q6UX46 152 aa15.26■□□□□ 0.03
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BLOC1S1P78537 153 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TWIST1Q15672 202 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NIT2Q9NQR4 276 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 K7EN84 100 aa15.24■□□□□ 0.03
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa15.24■□□□□ 0.03
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM243Q9BU79 118 aa15.22■□□□□ 0.03
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 LINC00528Q8N1L1 170 aa15.21■□□□□ 0.03
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM250H0YL14 139 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEBPGP53567 150 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCXQ7RTU7 201 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNFNQ9BYD5 112 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 REG3AQ06141 175 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PGLYRP4Q96LB8 373 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GATCO43716 136 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COTL1Q14019 142 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMIM15Q7Z3B0 74 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHAC1Q9BUX1 264 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa15.17■□□□□ 0.02
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 GTSF1Q8WW33 167 aa15.17■□□□□ 0.02
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