RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	RMI2	Q96E14	147 aa		7.83	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	VAX2	Q9UIW0	290 aa		7.83	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		7.83	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A087WX48	190 aa		7.82	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	GZMB	P10144	247 aa		7.82	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	RAB5C	P51148	216 aa		7.82	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	RAB19	A4D1S5	217 aa		7.81	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	ELOB	Q15370	118 aa		7.81	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		7.81	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		7.81	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464		Q8N976	141 aa		7.81	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	AP1S3	Q96PC3	154 aa		7.81	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	SST	P61278	116 aa		7.8	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	7.8	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464		Q0VG73	95 aa		7.8	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		7.8	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	SMIM12	Q96EX1	92 aa		7.8	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	PRR34	Q9NV39	138 aa		7.8	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464		M0QY20	66 aa		7.79	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	7.79	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	SCX	Q7RTU7	201 aa		7.79	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		7.79	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		7.79	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM262	E9PQX1	116 aa		7.78	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464		F5H697	171 aa		7.78	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	PDE6D	O43924	150 aa		7.78	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	BCL2	P10415	239 aa		7.78	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	GNG4	P50150	75 aa		7.78	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	RBX1	P62877	108 aa		7.78	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		7.78	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		7.78	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		7.78	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		7.78	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		7.78	□□□□□ -1.16
PTPRF-211	ENST00000467464	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		7.77	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		7.77	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC51B	Q86UW2	128 aa		7.77	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		7.77	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	TPPP3	Q9BW30	176 aa		7.77	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	USP17L23	D6RBM5	183 aa		7.76	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464		P01737	135 aa		7.76	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	MGP	P08493	103 aa		7.76	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	SMIM17	P0DL12	118 aa		7.76	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	CTRL	P40313	264 aa		7.76	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	PKIA	P61925	76 aa		7.76	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	CACNG7	P62955	275 aa		7.76	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	GAGE6	Q13070	117 aa		7.76	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	MIA	Q16674	131 aa		7.76	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		7.76	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		7.76	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464		F2Z2F3	143 aa		7.75	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	TEX46	H3BTG2	121 aa		7.75	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464		K7EN84	100 aa		7.75	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	CRP	P02741	224 aa		7.75	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		7.75	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464		Q6ZNX1	250 aa		7.75	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		7.75	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		7.75	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	NUDT11	Q96G61	164 aa		7.75	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	CNFN	Q9BYD5	112 aa		7.75	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	MED9	Q9NWA0	146 aa		7.75	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		7.75	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		7.74	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		7.74	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	IFNA1	P01562	189 aa		7.74	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	HLA-DQA1	P01909	254 aa		7.74	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	PRSS1	P07477	247 aa		7.74	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	NTF3	P20783	257 aa		7.74	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	RASL11A	Q6T310	242 aa		7.74	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		7.74	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		7.74	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		7.74	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		7.73	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	XKRY2	A2RUG3	117 aa		7.73	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464		H7C1H1	209 aa		7.73	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	TRGC1	P0CF51	173 aa		7.73	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	C14orf177	Q52M58	125 aa		7.73	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	WDR73	Q6P4I2	378 aa		7.73	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		7.73	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		7.73	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	OCC1	Q8TAD7	63 aa		7.72	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	GTSF1	Q8WW33	167 aa		7.72	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	NIT2	Q9NQR4	276 aa		7.72	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464	BIN3	Q9NQY0	253 aa		7.72	□□□□□ -1.17
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A1B0GUV1	79 aa		7.71	□□□□□ -1.18
PTPRF-211	ENST00000467464	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.18
PTPRF-211	ENST00000467464	PANO1	I0J062	215 aa		7.71	□□□□□ -1.18
PTPRF-211	ENST00000467464	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18

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