RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 TOR2AQ5JU69 321 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 TEX261Q6UWH6 196 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 NUDT11Q96G61 164 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 LECT2O14960 151 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 P01737 135 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 GZMBP10144 247 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 CTRLP40313 264 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 RAB4BP61018 213 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 WFDC2Q14508 124 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 GAGE12JA6NER3 117 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 F2Z2F3 143 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 GAGE1Q13065 139 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 GAGE4Q13068 117 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 GAGE5Q13069 117 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 GAGE13Q4V321 117 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 WDR73Q6P4I2 378 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 COX11Q9Y6N1 276 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 A0A087WWC5 75 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 XKRY2A2RUG3 117 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 UBE2D3P61077 147 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 UBE2D2P62837 147 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 CACNG7P62955 275 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 RMI2Q96E14 147 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 AP1S3Q96PC3 154 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-204ENST00000403441 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 Q8N3U1 123 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 CT83Q5H943 113 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 SCXQ7RTU7 201 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 LINC01551Q86U37 167 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 Q8N976 141 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 GTSF1Q8WW33 167 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 SMIM7Q9BQ49 75 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 ZNF56Q15929 161 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 LINC01620Q4KN68 170 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 BAALCQ8WXS3 180 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 C9JQL5 133 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 M0QY20 66 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 NTF3P20783 257 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 ZNF727A8MUV8 499 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 TRGC1P0CF51 173 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 NIT1Q86X76 327 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 TPPP3Q9BW30 176 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 OSTCQ9NRP0 149 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 FAM231BA6NCW3 169 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 A8MWL6 223 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 OXTP01178 125 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 SMIM17P0DL12 118 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-204ENST00000403441 A0A087WX48 190 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 CEBPGP53567 150 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 ELOBQ15370 118 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 ISOC2Q96AB3 205 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 KLK12Q9UKR0 248 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 H7C1H1 209 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 SSTP61278 116 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 C14orf177Q52M58 125 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 TSKUQ8WUA8 353 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 UBE2WQ96B02 151 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 V9GYV3 84 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 F5H697 171 aa8.06□□□□□ -1.12
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