RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SUPT3HB4E1H0 165 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ARMS2P0C7Q2 107 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PF4V1P10720 104 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HADHBP55084 474 aaKnown RBP-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CARD18P57730 90 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ARF1P84077 181 aaKnown RBP-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CST9Q5W186 159 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SKA1Q96BD8 255 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MAP3K5Q99683 1374 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NFAT5O94916 1531 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KIF14Q15058 1648 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TJP1Q07157 1748 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 QSER1Q2KHR3 1735 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MYH2Q9UKX2 1941 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C8orf87E5RJ46 101 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CYTH3O43739 400 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ATP5HO75947 161 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CALB1P05937 261 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TNFSF4P23510 183 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RAB8AP61006 207 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BLCAPP62952 87 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HBG1P69891 147 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HBG2P69892 147 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RGS21Q2M5E4 152 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NATD1Q8N6N6 113 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AQP10Q96PS8 301 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SMIM7Q9BQ49 75 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HDHD2Q9H0R4 259 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ANXA10Q9UJ72 324 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TPRKBQ9Y3C4 175 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 V9GYQ6 96 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NWD1Q149M9 1564 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MYH8P13535 1937 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ADGRL2O95490 1459 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A0B4J2E0 115 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ATP6V1G1O75348 118 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRACP01848 142 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC25A6P12236 298 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KCNE1P15382 129 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NME5P56597 212 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 REEP5Q00765 189 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 Q6ZT83 130 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AHSA2Q719I0 299 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMED4Q7Z7H5 227 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MUSTN1Q8IVN3 82 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SYCP3Q8IZU3 236 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GLYATL2Q8WU03 294 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ACOT13Q9NPJ3 140 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAIMQ9NVQ4 179 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MPC1Q9Y5U8 109 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SCN7AQ01118 1682 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGLC7A0M8Q6 106 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RNF13O43567 381 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SFT2D2O95562 160 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IFNA10P01566 189 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ORM1P02763 201 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IFNA8P32881 189 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RAB28P51157 221 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NDUFA6P56556 154 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GGTA1PQ4G0N0 100 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRBOX4Q5JUW0 171 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CMC1Q7Z7K0 106 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CLHC1Q8NHS4 586 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AGR3Q8TD06 166 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C7orf34Q96L11 122 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SCGB3A2Q96PL1 93 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-3.85□□□□□ -3.02
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DUOX2Q9NRD8 1548 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NPATQ14207 1427 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OOEPA6NGQ2 149 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OOSP1A8MZH6 123 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C1orf196B1AJZ1 125 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HSMCR30P0CW71 290 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CARTPTQ16568 116 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PSMG4Q5JS54 123 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCDC91Q7Z6B0 441 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CMTM1Q8IZ96 169 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMCO6Q96DC7 493 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCDC126Q96EE4 140 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CFAP36Q96G28 342 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MRAP2Q96G30 205 aa-3.85□□□□□ -3.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 225.5 ms