RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486508.1

AC245088.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC245088.1, Length 384 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC245088.1-201ENST00000486508 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 ERVFC1-1P60608 527 aa4.54□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 IFITM2Q01629 132 aa4.54□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 TMEM241Q24JQ0 296 aa4.54□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 SOHLH1Q5JUK2 328 aa4.54□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 SPANXN1Q5VSR9 72 aa4.54□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.54□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 SLC25A29Q8N8R3 303 aa4.54□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 AP1S3Q96PC3 154 aa4.54□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 GFRA4Q9GZZ7 299 aa4.54□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 NAT8Q9UHE5 227 aa4.54□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.54□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 A8MWL6 223 aa4.53□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 K7EP13 123 aa4.53□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 GATCO43716 136 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 LINC00694P0DN24 101 aa4.53□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 GYPEP15421 78 aa4.53□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 BTF3P20290 206 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 RAB4BP61018 213 aa4.53□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 RPL23P62829 140 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 ESRGQ1W209 222 aa4.53□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 UQCC3Q6UW78 93 aa4.53□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 LYPD5Q6UWN5 251 aa4.53□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 ZNRF2Q8NHG8 242 aa4.53□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 ISOC2Q96AB3 205 aa4.53□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 SAMD10Q9BYL1 202 aa4.53□□□□□ -1.68
AC245088.1-201ENST00000486508 DNAH10Q8IVF4 4471 aa4.52□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 A0A087WWL8 130 aa4.52□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 TRGC1P0CF51 173 aa4.52□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 SMIM17P0DL12 118 aa4.52□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 GZMBP10144 247 aa4.52□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 LINC00315P59091 139 aa4.52□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 FAM74A4Q5TZK3 123 aa4.52□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.52□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 Q6ZR54 194 aa4.52□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 C15orf54Q8N8G6 183 aa4.52□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 OR10G8Q8NGN5 311 aa4.52□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 TSKUQ8WUA8 353 aa4.52□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 GTSF1Q8WW33 167 aa4.52□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 TPPP3Q9BW30 176 aa4.52□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 JPT2Q9H910 190 aa4.52□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.52□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 DNAH2Q9P225 4427 aa4.52□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4.51□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 NTF3P20783 257 aa4.51□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 ADIRFQ15847 76 aa4.51□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 TTC32Q5I0X7 151 aa4.51□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 Q6ZSN1 163 aa4.51□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 FRZBQ92765 325 aa4.51□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 DPH3P1Q9H4G8 78 aa4.51□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 Q9H8V8 135 aa4.51□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 V9GYV3 84 aa4.51□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa4.5□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 A0A087WWC5 75 aa4.5□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.5□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.5□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 HIGD1CA8MV81 97 aa4.5□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 H7C1H1 209 aa4.5□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 PPP1R2P9O14990 202 aa4.5□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 SIVA1O15304 175 aa4.5□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.5□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 TWIST1Q15672 202 aa4.5□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 ZNF56Q15929 161 aa4.5□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 LELP1Q5T871 98 aa4.5□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa4.5□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 BORCS7Q96B45 105 aa4.5□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 DNAJC30Q96LL9 226 aa4.5□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.5□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.5□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 FRAS1Q86XX4 4008 aa4.5□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa4.49□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 MUC21A0A140T8X8 626 aa4.49□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 A0A1B0GUT8 65 aa4.49□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.49□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 LINC00862A6NCI5 91 aa4.49□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 GAGE12JA6NER3 117 aa4.49□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 M0QY20 66 aa4.49□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 EVI2AP22794 236 aa4.49□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 UBE2D3P61077 147 aa4.49□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 UBE2D2P62837 147 aa4.49□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 GAGE1Q13065 139 aa4.49□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 GAGE4Q13068 117 aa4.49□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 GAGE5Q13069 117 aa4.49□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 GAGE13Q4V321 117 aa4.49□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 TMEM97Q5BJF2 176 aa4.49□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 SMIM15Q7Z3B0 74 aa4.49□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.49□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.49□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.49□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa4.48□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa4.48□□□□□ -1.69
AC245088.1-201ENST00000486508 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms